Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di metodi per la predizioni degli effetti di mutazioni sulla stabilità proteica e predizione di siti di interazione proteina-proteina. |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of methods for the predictions of the protein stability changes upon mutations and prediction of protein-protein interaction sites. |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Biophysics |
| Area CUN | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/07 - FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA) |
| Descrizione sintetica in italiano | Nella prima parte dell’attività di ricerca verranno sviluppati metodi computazionali per poter predire l’impatto di mutazioni non sinonimiche sulla stabilità proteica,sia a partire dalla struttura tridimensionale sia dalla sola sequenza.Andranno quindi creati delle basi di dati aggiornate contenenti esempi sperimentali che poi saranno utilizzati per lo sviluppo di metodi di apprendimento automatic o dai dati.Si partirà utilizzando programmi già sviluppati,come INPS e Pro-Maya e si integreranno con un nuovo metodo che utilizzerà come informazione evolutiva anche ConSeq per migliorare l’accuratezza della predizione.In una seconda parte del progetto verranno sviluppati dei sistemi per l’identificazione di siti di interazione proteica a partire dalla singola catena.Come ultima fase della ricerca,verrà creato un database di mutazioni proteiche che hanno relazioni con malattie metaboliche su cui verranno applicati i metodo sviluppati per poter annotare mutazioni critiche. |
| Descrizione sintetica in inglese | The project consists of three phases. In the first phase we will develop a method to predict the impact of single point mutations on protein stability. This will be carried out starting from previously developed programs, such as INPS and Pro-Maya, then a third new program, based on machine-learning models, will be developed in order to exploit evolutionary information based on the ConSeq program. In the second part of the project, we will develop a method for the prediction of protein interaction sites starting from a single chain. Finally, a dataset of protein mutations related to metabolic diseases will be created to specifically test all the developed methods. |
| Data del bando | 29/09/2017 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | http://protocollo.unipd.it/albo |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | http://www.unipd.it |
| segreteria.bca@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 16/10/2017 |
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| Come candidarsi | Other |