Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | sequence analysis of snoRNA retaining transcripts |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Sequence analysis of snoRNA retaining transcripts |
Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Per studiare la biogenesi degli snoRT a full-length e 3'-, il candidato selezionato progetterà e implementerà una pipeline bioinformatica per valutare la presenza di caratteristiche condivise in un'ampia selezione di 3'-snoRT. La valutazione includerà una ricerca di motivi basata sulla sequenza e, data la nota complessità della struttura secondaria dello snoRNA, una ricerca basata sulla struttura predetta. I risultati ottenuti attraverso questa pipeline bioinformatica saranno ulteriormente convalidati utilizzando set di dati TCGA basati su nanopori disponibili al pubblico. Questa convalida guiderà infine lo sviluppo di un modello robusto per l'identificazione di nuovi 3'-snoRT. |
Descrizione sintetica in inglese | To investigate the biogenesis of full-length and 3’ snoRTs the selected candidate will design and implement a bioinformatic pipeline to evaluate the presence of shared characteristics among a large selection of 3’-snoRTs. The evaluation will include a sequence-based motif search and, given the known complexity of snoRNA secondary structure, a predictive structure based search. The findings obtained through this bioinformatic pipeline will be further validated using publicly available nanopore-based TCGA datasets. This validation will ultimately guide the development of a robust model for the identification of novel 3'-snoRTs. |
Data del bando | 10/06/2024 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE E CHIRURGICHE |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Bologna |
Sito web | http://www.unibo.it |
sam.nonstrutturati@unibo.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 02/09/2024 |
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Come candidarsi | Other |