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| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Genotipizzazione accurata e analisi dell’espressione tessuto-specifica del genoma mitocondriale umano mediante integrazione di dati WGS e dRNA-Seq |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Accurate Genotyping and Tissue-Specific Expression Analysis of the Human Mitochondrial Genome integrating whole genome and direct long-read RNA sequencing data |
| G.S.D. | 05/BIOS-08 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
| S.S.D | BIOS-08/A - Biologia molecolare |
| Descrizione sintetica in italiano | Questo studio introduce un approccio integrato e scalabile che combina sequenziamento dell’intero genoma (WGS) e sequenziamento diretto dell’RNA a lettura lunga (dRNA-seq) per una caratterizzazione ad alta risoluzione del genoma mitocondriale umano. Il metodo comprende l’applicazione di MitSorter, uno strumento che sfrutta le differenze epigenetiche tra mtDNA e NUMTs per distinguere accuratamente le letture, superando i limiti delle tecnologie short-read. L’analisi di 73 campioni provenienti da 15 tessuti potrà consentire una genotipizzazione affidabile e una valutazione dell’espressione tessuto-specifica. Il sequenziamento long-read permetterà inoltre di studiare trascritti completi, processi di maturazione dell’RNA e modificazioni post-trascrizionali. L’integrazione dei dati genomici e trascrittomici potrà collegare varianti mitocondriali alla loro espressione, rivelando firme regolative specifiche di tessuto. |
| Descrizione sintetica in inglese | This study introduces an integrated and scalable framework combining whole-genome sequencing (WGS) and direct long-read RNA sequencing (dRNA-seq) for high-resolution characterization of the human mitochondrial genome. A key innovation is MitSorter, a methylation-aware tool that distinguishes mtDNA from NUMTs, overcoming short-read limitations. Analysis of 73 samples across 15 tissues enabled accurate genotyping and tissue-specific expression profiling. Long-read RNA sequencing allows direct investigation of full-length transcripts, RNA processing, and post-transcriptional modifications. Integrating DNA and RNA variant data links mitochondrial genetic variation to transcriptional output, revealing tissue-specific regulatory signatures. |
| Data del bando | 24/08/2026 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
OTHER Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE OTHER |
| Sito web del bando | https://reclutamento.ict.uniba.it/ |
| Destinatari del contratto di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Bari Aldo Moro |
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| Tipologia dell'Ente | Other |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bari |
| Sito web | http://www.uniba.it |
| universitabari@pec.it |
| Contratto finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 08/09/2026 - alle ore 23:59 |
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| Come candidarsi | Other |