Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi dinamica di interfacce multidominio determinanti l'attivazione del recettore Ah |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Dynamic analyses of multidomain interfaces involved in the AhR receptor activation |
Campo principale della ricerca | Chemistry |
Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | CHIM/02 - CHIMICA FISICA |
Descrizione sintetica in italiano | un progetto riguardante lo studio del meccanismo di azione biologica del Aryl hydrocarbon Receptor, AhR, i cui ligandi a più alta affinità comprendono numerosi contaminanti ambientali. Obiettivo specifico è lo studio computazionale di alcuni stadi del meccanismo molecolare attraverso il quale il binding ai ligandi stimola la trasformazione di AhR nella forma capace di legare il DNA. In particolare verrà sviluppato un modello strutturale del complesso multidominio tra AhR e ARNT (AhR Nuclear Translocator), verranno caratterizzate le sue proprietà geometriche ed energetiche, analizzate le interazioni proteina-proteina alle interfacce di interazione, simulato il comportamento dinamico. Per questi obiettivi verranno utilizzati e sviluppati metodi di bioinformatica strutturale e di modellistica molecolare. I risultati saranno sottoposti a validazione sperimentale nell'ambito di una collaborazione in atto con la University of California, Davis. |
Descrizione sintetica in inglese | http://www.unimib.it/link/news.jsp?8707793872060555451 the research activity is part of a project aimed at elucidating the biological mechanism of the Aryl hydrocarbon Receptor, AhR, whose highest affinity ligands include a variety of environmental contaminants. The specific aim is to provide a detailed computational analysis of the molecular mechanisms by which ligand binding stimulates AhR transformation into its DNA binding form. In particular, studies will be addressed to: develop a structural model of the multi-domain complex of AhR with the ARNT (AhR Nuclear Translocator) protein; characterize its geometrical and energetic properties; analyze the protein-protein interaction interfaces; simulate the dynamic behavior. To this end, structural bioinformatics techniques and molecular modelling methods will be employed and developed. The results will be subjected to experimental validation, as a part of a collaborative project with the University of California, Davis. |
Data del bando | 06/08/2015 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.unimib.it/link/news.jsp?8707793872060555451 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) More Experienced researcher or >10 yrs (Senior) Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi Milano-Bicocca |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://unimib.it |
bandi.assegni_borse@unimib.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 31/08/2015 |
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Come candidarsi | Other |