Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Profilo dell'editing dell'RNA nei tumori: valutazione mediante dati NGS (next-generation sequencing) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | A RNA editing signature in cancer: evaluation by next-generation sequencing data |
Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
S.S.D | MED/01 - STATISTICA MEDICA |
Descrizione sintetica in italiano | Lo scopo di questo progetto è di valutare, inizialmente attraverso analisi bioinformatiche utilizzando i dati depositati in banche date pubbliche, quali TCGA e analizzandoli tramite algoritmi ad hoc, se diversi tipi di tumore o sottotipi tumorali possano evidenziare una specifica "RNA editing signature". Ulteriore step sarà la validazione biologica dei dati trovati, mediante le tecnologie di sequenziamento classico su RNA estratto da tessuti tumorali e per-tumorali. Infine, una volta determinati i siti di editing con frequenza differente nelle cellule tumorali, si potrà capire quale degli enzimi ADAR (Adenosin Deaminasi che agiscono sull'RNA) che mediano la reazioni di editing, è coinvolto nelle modificazioni riportate e si cercherà di capirne le regolazioni funzionali tumore dipendente. |
Descrizione sintetica in inglese | The RNA editing is now widely recognized as a very important process for the regulation of gene expression in human cells and its alteration is implicated in numerous diseases. The aim of this project is to evaluate, first at the bioinformatic level, using the RNA- DNA seq data deposited in public databases, as TCGA, and analyzing them through ad hoc algorithms, if different types or subtypes of cancer can highlight a specific "RNA editing signature". A further step will be the biologica! evaluation of data found, through classica] sequencing technologies on RNA extracted from cancer cells and peri-cancer cells. Finally, we could figure out which ADAR enzyme (adenosine deaminase acting on RNA) is involved in the modifications reported and understand its functional modification induced by the tumor progression. |
Data del bando | 02/10/2015 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.unibs.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Brescia |
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Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Brescia |
Codice postale | 25123 |
Indirizzo | Viale Europa 11 |
Sito web | http://www.unibs.it |
maria.defazio@unibs.it | |
Telefono | 030-3717401 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 02/11/2015 |
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Come candidarsi | Other |