Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di strumenti open source per l’analisi genomica con GMQL . |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | An open-source integrated toolsuite for the GMQL language. |
Settore Concorsuale | 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’analisi di terzo livello dei dati genomici è tipicamente realizzata con molteplici metodi ad-hoc, poiché l’unico strumento integrato disponibile agli scienziati per interrogare ed analizzare dataset pubblici o privati è un prodotto commerciale (Paradigm4). C’è quindi un grande bisogno di strumenti analoghi che siano liberamente disponibili, e il programma di ricerca mira a svilupparne un prototipo basato su tecnologie open-source (in particolare, Apache Flink e Spark). Tale prototipo dovrà permettere la formulazione di task di analisi anche complessi tramite astrazioni potenti e semplici da utilizzare per biologi e bioinformatici anche privi di competenze specifiche di tecnologia informatica, per incapsulare opportunamente il ricorso a tecniche di data mining e machine learning. |
Descrizione sintetica in inglese | The tertiary analysis of genomic data is typically made with ad-hoc solutions. The only tool with a holistic approach to genomics is a commercial product (Paradigm4), designed for scientists to query and analyze both public and private repository data. There is a strong need for an open-access equivalent tool, and this research program aims at developing a prototype of such a system on top of open-access technologies (in particular, Apache Flink e Spark). The system shall support the users in easily building data analysis applications (based on Machine Learning and Data Mining methods) for processing the results of GMQL queries, with abstractions suitable for biologists or life scientists, who typically lack strong computer science skills. |
Data del bando | 05/11/2015 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
AFRICA EUROPE OCEANIA NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OCEANIA AFRICA EUROPE NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
Sito web del bando | http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Per partecipare alla selezione, si prega di leggere il bando disponibile sul sito web: http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | In order to participate in the selection, please read the call (“bando”) available at the following website: http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Elettronica, Informazione e Bioingegneria |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://www.deib.polimi.it |
assegniricerca@polimi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 22/12/2015 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |