Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Indicizzazione di campioni NGS per l’estrazione efficiente di sequenze genomiche. |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Indexing of NGS samples for optimized processing of retrieval queries. |
| Settore Concorsuale | 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Per processare moli elevate di campioni NGS (Next Generation Sequencing) occorrono specifiche ottimizzazioni: i dataset documentano infatti centinaia di milioni di possibili interazioni tra sottosequenze genomiche, e la loro interpretazione biologica si effettua tramite query di specifica intensionale di sequenze sovrapposte. Il progetto di ricerca mira a fornire alla comunità scientifica una libreria di algoritmi ottimizzati per indicizzare dati biologici e permettere la ricerca efficiente di specifiche sottosequenze; inoltre, l’eterogeneità delle tipiche indagini biologiche impone di supportare l’integrazione di query custom in query standard. Inoltre, per raggiungere la più ampia platea di utenti, l’implementazione dovrà essere indipendente da specifiche piattaforme. |
| Descrizione sintetica in inglese | Processing large numbers of Next Generation Sequencing samples requires optimized techniques, as a typical dataset (a collection of samples) potentially contains, overall, hundreds-of-millions of biological interactions presented by genomic intervals, and biological interpretations of these datasets are made via in-depth retrieval queries. This research project aims at providing the community with libraries with highly optimized algorithms to index biological data and perform very fast retrievals. The variety of retrievals that facilitate various biological interpretations calls for custom aggregations to be “pluggable” by end-users within standard queries, and in order for the contribution to be as widely targeted as possible the implementation shall be platform-independent. |
| Data del bando | 05/11/2015 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
AFRICA OCEANIA EUROPE NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
AFRICA OCEANIA EUROPE NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
| Sito web del bando | http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Per partecipare alla selezione, si prega di leggere il bando disponibile sul sito web: http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | In order to participate in the selection, please read the call (“bando”) available at the following website: http://www.polimi.it/lavora-con-noi/collaborazioni-di-ricerca/assegnidiricerca/ |
| Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Elettronica, Informazione e Bioingegneria |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Milano |
| Sito web | http://www.deib.polimi.it/ |
| assegniricerca@polimi.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 22/12/2015 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |