Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Caratterizzazione del profilo di espressione genica mediante RNA-SEQ in cellule eritroidi nella beta-talassemia. |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Characterization of the gene expression profile by RNA-SEQ in erythroid cells in beta-thalassemia. |
| Campo principale della ricerca | Medical sciences |
| Sottocampo della ricerca | Medicine |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | MED/38 - PEDIATRIA GENERALE E SPECIALISTICA |
| Descrizione sintetica in italiano | Il sequenziamento dell’RNA è una delle tecniche più promettenti per la sua capacità di definire un'ampia varietà di alterazioni quali espressione genica, splicing alternativo, RNA editing. L’RNA sarà estratto da cellule eritroidi di pazienti affetti da beta-talassemia e la ricerca si focalizzerà nello studio dell'espressione genica differenziale mediante analisi statistiche e multivariate, gestione database e statistica applicata ai dati biologici e clinici. Il candidato provvederà all’installazione e all’implementazione, tramite script di programmazione, di tutti i software open-source necessari all’analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento dell’RNA e successivamente eseguirà procedure di controllo qualità e analisi primaria e secondaria: allineamento di sequenze (BowTie, TopHat, STAR), analisi multivariata (PCA, BoxPlot, Clustering), espressione differenziale (Cufflink, DeSeq, EdgeR), interpretazione dei risultati. |
| Descrizione sintetica in inglese | RNA sequencing is one of the most promising techniques for its ability to define a wide variety of alterations such as gene expression, alternative splicing, RNA editing. RNA will be extracted from erythroid cells of beta-thalassemia patients and research will focus in the study of differential gene expression and multivariate statistical analysis, database management and statistics applied to biological and clinical data. The candidate will provide installation and deployment, by scripted programming, of all open-source software necessary for bioinformatics analysis of RNA sequencing data and then perform quality control procedures and analyzes primary and secondary: alignment sequences (BowTie, TopHat, STAR), multivariate analysis (PCA, BoxPlot, Clustering), differential expression (Cufflink, DeSeq, EdgeR), interpretation of the results. |
| Data del bando | 11/03/2016 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | http://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Regione Autonoma della Sardegna |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | http://www.regione.sardegna.it |
| pmoi@unica.it | |
| Telefono | 0039070503341 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 31/03/2016 |
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| Come candidarsi | Other |