Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Algoritmi per la predizione di eventi di splicing alternativi a partire da serie temporali di dati di RNA-Seq |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Algorithms to predict alternative splicing events from RNA-Seq time serie |
| Campo principale della ricerca | Computer science |
| Sottocampo della ricerca | Other |
| Settore Concorsuale | 01 - Scienze matematiche e informatiche |
| S.S.D | INF/01 - INFORMATICA |
| Descrizione sintetica in italiano | Il progetto prevede di trattare e analizzare dati provienti da tecnologie di sequenziamento di nuova generazione NGS, principalmente single-cell, al fine di individuare nuovi eventi di splicing e confermare gli eventi già presenti nelle banche dati. In particolare, il candidato dovrà disegnare ed implementare nuovi algoritmi efficienti per indicizzare dati NGS, siccome gli algoritmi attualmente noti non sono adatti a trattare la enorme quantità di dati che caratterizza le tecnologie NGS. Inoltre contribuirà al disegno ed allo sviluppo di nuovi strumenti software in tale ambito. I dati da trattare provengono da cellule Treg e saranno prodotti dall'Istituto Nazionale di Genetica Molecolare, che è partner del progetto, e consistono in un insieme di serie temporali di dati estratti da diversi individui. |
| Descrizione sintetica in inglese | http://www.unimib.it/link/news.jsp?308772719408958287 This research project focuses on the management and analysis of biological data originating from next generation sequencing technologies (NGS), and mainly consist of single-cell data. The expected outcome of the project is to identify novel alternative splicing events and to confirm the annotations that are already in the databases. More precisely, the candidate will design and implement new efficient algorithm to index NGS data, since the currently available algorithm are not suited to the amount of data characterizing the output of the NGS technologies. Moreover, the candidate will give a contribution to the design and the development of innovative programs in this field. The data to be analyzed will originate from Treg cells and will be produced by the National Institute of Molecular Genetics, which is a partner of the project. Those data consists of several time series, one for each individual studied. |
| Data del bando | 20/04/2016 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE AFRICA OCEANIA NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE AFRICA OCEANIA NORTH AMERICA SOUTH AMERICA ASIA OTHER |
| Sito web del bando | http://www.unimib.it/link/news.jsp?308772719408958287 |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Milano-Bicocca |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Milano |
| Sito web | http://www.unimib.it |
| bandi.assegniborse@unimib.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 10/05/2016 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |