Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi molecolare del microbiota intestinale in pazienti affetti da tumore del colon-retto (Pubblicato sull’Albo Ufficiale con numero 3349) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular analysis of micrbiota in patients affected by colorectal cancer (Published on the “Albo Ufficiale” with number 3349) |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Biology |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/18 - GENETICA |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto di ricerca prevede la caratterizzazione metagenomica del microbiota da campioni salivari, fecali e tissutali da pazienti con tumore del colon-retto durante le fasi preoperatorie e postoperatorie. Le sequenze generate con tecnologia NGS verranno sottoposte ad un controllo di qualità. Le sequenze controllate saranno sottoposte a clustering per dividerle in “Operational Taxonomic Units” sulla base della loro similarità nucleotidica. L’ultimo passaggio sarà quello di indentificare la tassonomia di ogni sequenza mediante il confronto con banche dati dedicate disponibili. I dati così ottenuti per ciascun campione verranno confrontati tra di loro in modo da valutare eventuali differenze nella composizione della flora intestinale. Quest’ultimo passaggio comporterà l’utilizzo di tecniche di statistica multivariata e la creazione di modelli matematici basati sulla composizione batterica ottenuta. |
Descrizione sintetica in inglese | This project is aimed at performing metagenomic analyses on microbial communities present in biological samples collected from patients with colorectal cancer. Specimens will be collected during pre- and post-operative phases. Sequences obtained through NGS sequencing will be first quality checked. Next, filtered sequences will be clustered into “Operational Taxonomic Units” based on their similarity level. Finally, representative sequences from each OTU will be taxonomically classified by aligning them to reference databases. Doing so, we will be able to compare different samples from different patients searching for specific distribution patterns that could be related to clinical status. Multivariate data analyses and mixed-effect models will be used to link the bacterial distribution to disease severity in order to find new putative targets for personalized therapies. |
Data del bando | 26/05/2016 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 23462 |
Periodicità | annuale |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | http://www.unifi.it/vp-9008-albo-ufficiale.html |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 23462 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | dottorato di ricerca, esperienza in analisi bioinformatiche su dati di microbiomi |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | PhD, experience in bioinformatics analyses on microbiome data |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Il concorso è per titoli e per colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The competition will be carried out by an evaluation of titles and examination and by means of an interview” |
Nome dell'Ente finanziatore | UNIVERSITA'DEGLI STUDI DI FIRENZE - DIPARTIMENTO DI BIOLOGIA |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | FIRENZE |
Codice postale | 50019 |
Indirizzo | via Madonna del Piano, n. 6 - Sesto Fiorentino (Firenze) |
Sito web | http://www.unifi.it) |
direttore@bio.unifi.it | |
Telefono | 055 4574743 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 10/06/2016 |
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Come candidarsi | Other |