Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studi di espressione genica in diatomee in risposta a variazioni ambientali |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Gene expression in diatoms in response to environmental cues |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Le diatomee, responsabili di una parte importante della fotosintesi sulla Terra, sono spesso esposte alla turbolenza. Il cambiamento climatico è destinato a modificare l'intensità del mescolamento negli oceani, tuttavia la comprensione dei meccanismi di adattamento delle microalghe rimane sfuggente, pur essendo di interesse anche per applicazioni industriali. Gli studi sono stati ostacolati dalla difficoltà, superata dal NGS, di accedere agli stati metabolici cellulari. Lo scopo è di definire gli adattamenti specifici al mescolamento a microscala combinando esperimenti di trascrittomica realizzati con uno strumento in-house che riproduce la turbolenza naturale, con l'analisi del metatranscrittoma globale. |
Descrizione sintetica in inglese | Diatoms, responsible for an important part of photosynthesis on Earth, are often exposed to mixing. While climate change is projected to change the oceans’ mixing intensity, the understanding of adaptive mechanisms remain elusive while being of potential interest for industrial applications. Studies have been hampered by the difficulty to access to the cell metabolic states, now overcome by NGS. The project aim is to define the components of the metabolism that are specific adaptations to microscale mixing by combining transcriptomic experiments using an in-house instrument that faithfully reproduces natural turbulence with the analysis of the global metatranscriptome (Tara Oceans Project). The candidate will address the questions: i) what is the minimal gene set required to respond specifically to turbulence ii) how widespread is the mechanism iii) what is the role of turbulence in nutrient deplete conditions iv) what evidence can be found in natural samples. |
Data del bando | 22/09/2016 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 27000 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
E.U. |
Paesi di residenza dei candidati |
E.U. |
Nazionalità dei candidati |
E.U. |
Sito web del bando | http://www.szn.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
More Experienced researcher or >10 yrs (Senior) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 27000 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Altri costi in italiano | Il/la candidato/a deve possedere conoscenze di fisiologia algale ed esperienza con metodi molecolari (estrazione DNA/RNA, PCR, etc), sono desiderabili competenze in coltivazione algale ed esperienza con high-throughput sequencing, analisi di trascrittomi e metatrascrittomi. Per la partecipazione al concorso sono richiesti i seguenti requisiti: il candidato deve possedere esperienza post laurea maggiore di 10 anni sulla tematica del concorso oppure un dottorato in Scienze Biologiche, Biologia, Biologia delle produzioni marine, Biotecnologie, Scienze e Tecnologie Genetiche, Genomica Funzionale o in discipline attinenti alla biologia molecolare e alla genomica, con una esperienza di post dottorato maggiore di 5 anni, oppure essere coautore di almeno 10 pubblicazioni in riviste ISI attinenti alla tematica del progetto. |
Altri costi in inglese | Candidates must have good background knowledge of algal physiology and practical experience in molecular methods (DNA/RNA extraction, PCR, etc). Expertise with algal cultivation, high-throughput sequencing, transcriptome and meta-transcriptome data analysis are desirable. To participate in the competition, candidates must possess the following qualifications: candidates are required to have either more than 10 years of research experience from the master degree on topics related to the project, or a PhD in Biological Sciences, Biotechnology, Functional Genomics or disciplines related to molecular biology and genomics and over 5 years of experience after PhD, or to have published at least 10 ISI papers in fields related to the project. |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all’esame dei titoli e all’espletamento di un colloquio, teso ad accertare la competenza scientifico-professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda. |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | Candidates must have good background knowledge of algal physiology and practical experience in molecular methods (DNA/RNA extraction, PCR, etc). Expertise with algal cultivation, high-throughput sequencing, transcriptome and meta-transcriptome data analysis are desirable. To participate in the competition, candidates must possess the following qualifications: candidates are required to have either more than 10 years of research experience from the master degree on topics related to the project, or a PhD in Biological Sciences, Biotechnology, Functional Genomics or disciplines related to molecular biology and genomics and over 5 years of experience after PhD, or to have published at least 10 ISI papers in fields related to the project |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all’esame dei titoli e all’espletamento di un colloquio, teso ad accertare la competenza scientifico-professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda. |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Competition based on qualifications and colloquio. La assessment of the candidates will be conducted by a special jury, which will examine the qualifications and the performance of an interview aimed at ascertaining the candidate's professional expertise in scientific, as well as his attitude to carry out specific research subject of the application |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica Anton Dohrn |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | villa comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
daniele.iudicone@szn.it | |
Telefono | +39 0815833200 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 04/11/2016 |
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Come candidarsi | Other |