Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi bioinformatica di interazione tra RNA e proteine in epigenomica |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational analysis of RNA-protein interaction in epigenomics |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Scopo del progetto è ottenere informazioni sulla rete di interazioni tra RNA e le proteine dell'apparato di modificazione della cromatina. Per questo scopo, intendiamo sviluppare delle procedure per l'inferenza delle regole che determinano l'interazione tra proteine ed RNA, a partire da coppie RNA-proteina identificate sperimentalmente. Costruiremo modelli di interazione sia a livello di struttura primaria che terziaria e quaternaria. Integrando il folding dell'RNA con i pattern di sottostrutture locali conservate, intendiamo estendere tali regole all'analisi dei complessi lncRNA-proteine coinvolti nei processi epigenetici. I livelli di espressione dei lncRNA e gli stati della cromatina verranno usati per determinare come e quando il lncRNA eserciti la sua influenza sull'epigenoma |
Descrizione sintetica in inglese | We aim at obtaining a detailed picture of the interaction networks that link RNAs and the proteic part of the chromatin modification machinery. In order to do so, we aim at developing procedures for the inference of the rules governing protein-RNA interactions, training and testing them on experimentally determined protein-RNA pairs, and modeling the interaction at all possible levels (from primary to quaternary structure). By the integration of RNA folding and emerging patterns of conserved local substructures with experimentally determined binding between RNA and proteins, we aim at determining the rules guiding the interaction, and extend them to the analysis of the lncRNA-mediated regulation of epigenetic control. Expression levels of lncRNA and chromatin states will be used to determine how and when lncRNA exert their influence on the epigenome. |
Data del bando | 28/09/2016 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.uniroma2.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | UNIVERSITA DEGLI STUDI DI ROMA TOR VERGATA - DIPARTIMENTO DI BIOLOGIA |
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Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | ROMA |
Sito web | http://WWW.UNIROMA2.IT |
ASSEGNI.RICERCA@AMM.UNIROMA2.IT | |
Telefono | 06 72 59 23 44 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 18/10/2016 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | http://concorsionline.uniroma2.it/ |