Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Risposta trascrittomica di organismi fotoautotrofi marini alle variazioni ambientali |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Transcriptomic response of autotrophic marine organisms to environmental factors |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Gli organismi fotoautotrofi marini sono sottoposti a forti variazioni dell’ambiente che li circonda e soffrono in particolare per le variazioni di temperatura e di luce e per l’elevato apporto di nutrienti. Le sperimentazione in corso alla SZN combinano approcci trascrittomici ed eco-fisiologici, e le analisi dei risultati trascrittomici, ottenuti con la macchina Ion-Torrent in dotazione all’Unità di Biologia Molecolare e Bioinformatica della Stazione Zoologica, richiedono la presenza di un biologo con esperienza in bioinformatica, in grado di analizzare i dati ed interfacciarsi con i ricercatori. Il candidato avrà il compito di mettere a punto le pipelines di analisi dei dati del sequenziatore Ion-Proton, di analizzare i dati trascrittomici attraverso tutte le fasi di analisi, dal de novo assembly, alla annotazione ed alla espressione differenziale. Il candidato dovrà inoltre partecipare alla interpretazione biologica ed ecologica dei dati |
Descrizione sintetica in inglese | Photoautotrophic marine organisms are subjected to strong variations in their environment and suffer in particular for variations in temperature and light and for the increased supply of nutrients. The experiments under way at SZN combine transcriptomic and eco - physiological approaches. The analysis of the RNA-Seq massive sequencing, obtained using the Ion Proton present at the Unit of Molecular Biology and Bioinformatics of the Stazione Zoologica, requires the presence of a biologist with expertise in bioinformatics, able to analyze the data and to interface with researchers responsible for the biological aspects of the research. The candidate will be responsible for standardizing the data-analysis pipelines for the Ion Proton, for analyzing the transcriptomic data through all the phases of analysis, by de novo assembly, to annotation and differential expression. The candidate must also participate in the interpretation of biological and ecological data. |
Data del bando | 29/09/2016 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 24000 |
E' richiesta mobilità internazionale? | yes |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | http://www.szn.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 24000 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | ): Per la partecipazione al concorso i candidati dovranno essere in possesso dei seguenti requisiti: più di 7 anni di esperienza post-laurea, oppure Dottorato di Ricerca in Scienze Biologiche o simili conseguito da più di 3 anni, oppure partecipazione come co-autore ad almeno 5 pubblicazioni su riviste internazionali ISI. |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | To participate in the competition, candidates must possess the following qualifications: more than 7 years post-graduation experience, or PhD in Biological Sciences or Equivalent obtained from more than 3 years, or participation as a co-author in at least 5 publications in international ISI journals |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all’esame dei titoli e all’espletamento di un colloquio, teso ad accertare la competenza scientifico-professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Competitive selection based on qualifications and interview. The assessment of the candidates will be conducted by a committee which will examine the qualifications and the performance in an interview aimed at ascertaining the candidate's professional expertise in the scientific field, as well as his/her attitude to carry out the specific research |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica Anton Dohrn |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | Villa Comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
gpro@szn.it | |
Telefono | +039081 5833200 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 20/10/2016 |
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Come candidarsi | Other |