Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Regolazione trascrizionale della risposta agli stress e loro combinazioni nella vite: analisi bioinformatiche e modellizzazione di dati RNAseq |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Transcriptional responses to multiple stress and their combinations in grapevine: bioinformatics analyses and modelling of RNAseq data |
| Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
| S.S.D | AGR/03 - ARBORICOLTURA GENERALE E COLTIVAZIONI ARBOREE |
| Descrizione sintetica in italiano | L’assegnista sarà impegnato nell’analisi e nella modellizzazione della risposta trascrizionale della vite agli eventi estremi e loro combinazioni. In particolare l’assegnista sarà impegnato nelle seguenti attività: 1. messa a punto della piattaforma bioinformatica (i.e. scelta del genoma di riferimento e della pipeline più opportuna da adottare); 2. allineamento delle reads grezze derivanti da RNAseq al genoma di riferimento della vite e generazione dei valori RPKM/FPKM per singolo gene; 3. analisi statistica dei dati ed individuazione dei geni differenzialmente espressi; 4. eventuali analisi di arricchimento/funzionali basate su geneontology/MapMan e altre piattaforme di genomica funzionale; 5. messa a punto di un modello rappresentativo della regolazione trascrizionale della risposta della vite agli stress considerati nel progetto 6. eventuale integrazione del modello con i dati biometrici ed ecofisiologici. |
| Descrizione sintetica in inglese | The post-doc researcher will be involved in a systematic analysis and modelling of grapevine transcriptional response to extreme events. The following activities will be carried out by the candidate: 1. setting up of the bioinformatic platform (i.e. choosing the reference genome and the most suitable pipeline) 2. mapping the RNAseq reads to the reference genome and generating the RPKM/FPKM values for each single gene; 3. statistical analysis of data and identification of the differentially expressed genes; 4. enrichment/functional analyses based upon geneontology/MapMan and other functional genomics platforms; 5. setting up of a model representative of the transcriptional regulation of the grape’s response to the stress considered in the project; 6. integration of the model with biometric and ecophysiological data. |
| Data del bando | 09/02/2017 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Stanziamento annuale (indicativo) | 19367 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | http://protocollo.unipd.it/albo/albo.html |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
|---|---|
| Importo annuale | 19367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | La selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico-professionale, della produttività scientifica e di un colloquio. |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The selection will be carried out through the evaluation of degrees, scientific-professional curriculum, scientific outputs and an interview. |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Il colloquio si terrà presso la sede del Dipartimento DAFNAE Viale dell'Università 16 35020 Legnaro (PD) Italia. Non sono ammessi colloqui a distanza. |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The interview will be held at the Department DAFNAE Viale dell'Università 16 35020 Legnaro (PD) Italy. Remote interviews are not allowed. |
| Nome dell'Ente finanziatore | UNIVERSITA' DI PADOVA - DIPARTIMENTO DAFNAE |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Legnaro (Padova) - Italy |
| Codice postale | 35020 |
| Indirizzo | Viale dell'Università 16, 35020 Legnaro (Padova) Italy |
| Sito web | http://protocollo.unipd.it/albo/albo.html |
| Sito web | http://www.dafnae.unipd.it/news/termine/2 |
| franco.meggio@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 24/02/2017 - alle ore 00:00 |
|---|---|
| Come candidarsi | Other |