Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Applicazione di metodi di sequenziamento ad alta processività per la caratterizzazione di isolati batterici di origine clinica |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Application of next-generation sequencing methods for the characterization of bacterial isolates of clinical origin |
| Campo principale della ricerca | Medical sciences |
| Sottocampo della ricerca | Medicine |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
| Descrizione sintetica in italiano | L’obiettivo principale del presente progetto di ricerca è l’ analisi di isolati batterici di origine clinica tramite metodiche di sequenziamento massivo, al fine di caratterizzare geni di resistenza noti, meccanismi nuovi di antibiotico-resistenza (con particolare riferimento ai meccanismi emergenti di resistenza alla colistina ed ai carbapenemi), fattori di virulenza e relazioni clonali. Gli isolati batterici di origine clinica, selezionati in base a fenotipi eccezionali di antibiotico-resistenza e/o appartenenza a cluster epidemici, verranno analizzati tramite metodiche di riferimento per verificarne l’ antibiogramma e identificati nuovamente a livello di specie tramite tecnologia MALDI-TOF. Il genoma verrà quindi estratto e sequenziato tramite tecnologia Illumina con approccio paired-ends ed, eventualmente, anche tramite tecnologia Oxford Nanopore al fine di ottenere la sequenza ricostruita dell’ intero genoma e dei plasmidi. |
| Descrizione sintetica in inglese | The main objective of the present research project is the analysis of bacterial isolates of clinical origin by using next-generation sequencing methods, with the aim of genotyping known resistance genes, novel mechanisms of antibiotic resistance (with particular focus on the emerging mechanisms of resistance to colistin and to carbapenems), virulence factors and clonal relationships. Bacterial isolates of clinical origin, selected on the basis of clinically relevant resistance phenotypes and / or for being associated to epidemic clusters, will be analysed by reference methods to verify their antibiotic susceptibility and re-identified at the species level by MALDI-TOF technology. The genome will then be extracted and sequenced by Illumina technology with paired-ends approach and, possibly, also by means of technology Oxford Nanopore in order to obtain the complete genome sequence and closed plasmids |
| Data del bando | 06/04/2017 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
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| Paesi di residenza dei candidati |
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| Nazionalità dei candidati |
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| Sito web del bando | http://albo.unisi.it/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Siena |
| Sito web | http://www.unisi.it |
| amministrazione.dbm@unisi.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 26/04/2017 |
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