Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | (Italiano) Identificazione e caratterizzazione di neocentromeri nei tumori mediante analisi di immuno-FISH e ChIP-Seq. |
---|---|
Titolo del progetto di ricerca in inglese | Identification and characterization of neocentromeres in tumors by immuno-FISH and ChIP-Seq approaches. |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L'amplificazione genomica sotto forma di cromosomi ad anello o marcatori giganti lineari (RGM) è una comune alterazione genetica nei tumori dei tessuti molli. La stabilità mitotica di queste strutture viene spesso preservata dall’insorgenza di neocentromeri (NC) analfoidi perfettamente funzionanti. Tuttavia, pochissimi studi si sono concentrati sui NC e sul loro impatto sul trascrittoma nei tumori. Abbiamo studiato la struttura di NC in tre linee cellulari di liposarcoma ben differenziato (WDLPS) come mosaici di sequenze amplificate multiple. È interessante notare che abbiamo trascritti chimerici originati da diverse regioni dell'intero RGM, per lo più attribuibili ad alterazioni genomiche complesse o eventi post-trascrizionali. Intendiamo verificare i nostri risultati su WDLPS primari con neocentromeri mediante uno screening preliminare per immunoFISH e successivamente per Immuno-precipitazione cromatinica |
Descrizione sintetica in inglese | Genome amplification in the form of rings or giant rod-shaped marker chromosomes (RGM) is a common genetic alteration in soft tissue tumours. The mitotic stability of these structures is often rescued by the emergence of perfectly functioning analphoid neocentromeres (NCs). Nonetheless, very few studies focused on neocentromeres and their impact on transcriptome in tumors. We disentangled NCs occurring in three well-differentiated liposarcoma (WDLPS) cell lines as patchworks of multiple short amplified sequences. Interestingly, we found chimeric transcripts originating from the entire RGM, mostly attributable to complex genomic rearrangements or post-transcriptional events. We intend to verify our results on primary WDLPS with NCs by a preliminary screening by immunoFISH |
Data del bando | 26/06/2017 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
OTHER Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER Italy |
Nazionalità dei candidati |
Italy OTHER |
Sito web del bando | http://www.apd.ict.unba.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
---|
Nome dell'Ente finanziatore | AIRC - Milano |
---|---|
Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://www.airc.it |
airc.direzione-scientifica@airc.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
---|
Data di scadenza del bando | 26/07/2017 - alle ore 00:00 |
---|---|
Come candidarsi | Other |