Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studi di dinamica molecolare per il calcolo di grandezze termodinamiche e cinetiche associate all’interazione farmaco-recettoriale |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular dynamics studies to estimate thermodynamic and kinetic quantities associated to drug-target binding |
| Campo principale della ricerca | Pharmacological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Pharmacy |
| Campo principale della ricerca | Chemistry |
| Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Biophysics |
| Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Il presente progetto di ricerca è volto allo sviluppo di metodiche computazionali per il calcolo di grandezze termodinamiche e Cinetiche associate all’interazione farmaco-recettore. Il metodo di elezione per lo sviluppo del progetto è la dinamica molecolare e metodi ad essa correlati con i quali è possibile accelerare il campionamento di microstati preservandone la corretta distribuzione statistica (umbrella sampling e metadinamica in primis). In particolare, il presente progetto verte: i) sull’estrazione di opportune coordinate di reazione[10] che descrivano il processo di associazione/dissociazione del complesso farmaco-recettore a partire da traiettorie di dinamica molecolare sufficientemente estese (ordine di grandezza nel microsecondo) ii) sulla stima del profilo di energia libera attraverso l’impiego dei suddetti metodi di campionamento accelerato. Il suddetto protocollo verrà applicato su sistemi di interesse farmaceutico, quali i recettori metabotropici. |
| Descrizione sintetica in inglese | The present research proposal focuses on the development of computational techniques to estimate thermodynamic and kinetic quantities associated to drug-target binding. The project will be based on molecular dynamics (MD) and related methods suited to enhance the sampling of microstates and preserving at the same time their statistical weight (mostly metadynamics and umbrella sampling). In details, the present project will address the following aspects: i) extracting proper reaction coordinates able to describe the binding/unbinding process of drug-target complexes from exhaustive MD trajectories ii) estimating the free energy profile by means of the aforementioned enhanced sampling methods The devised methodology will be validated to the study of pharmaceutically relevant systems, such as metabotropic receptors. |
| Data del bando | 16/10/2017 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| matteo.masetti4@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 03/11/2017 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |