Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Set-up della procedura sperimentale PAT-ChIP e sua applicazione allo studio dell’epigenoma in modelli biologici complessi (tessuti FFPE) |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Setting of PAT-ChIP procedure and its application to epigenomic investigations in complex biological models (FFPE tissues) |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | MED/46 - SCIENZE TECNICHE DI MEDICINA DI LABORATORIO |
| Descrizione sintetica in italiano | La recente introduzione di una nuova tecnica di immunoprecipitazione della cromatina, denominata PAT-ChIP, ha consentito di estendere lo studio dell’intero epigenoma a modelli biologici complessi quali i campioni patologici FFPE. L’elevata eterogeneità nei protocolli utilizzati per la preparazione dei tessuti FFPE rende però complessa la conduzione di studi genome-wide mediante PAT-ChIP abbinata a sequenziamento NGS (PAT-ChIP-seq). Il progetto verrà così articolato: i) miglioramento della tecnica di estrazione della cromatina da campioni FFPE; ii) set up della procedura di valutazione della qualità della cromatina prima del suo utilizzo; iii) setting dell’analisi genomica mediante l’utilizzo della nuova piattaforma NGS in-house; iv) preliminare applicazione allo studio della modulazione dell’epigenoma di modelli murini in funzione dell’invecchiamento e/o di diversi regimi dietetici. |
| Descrizione sintetica in inglese | The recent introduction of a new procedure for chromatin immunoprecipitation approaches, named PAT-ChIP, enabled the extension of epigenomic studies to complex biological models such as pathological FFPE samples. The high heterogeneity of the protocols used for the preparation of pathology FFPE tissues complicates the conduction of genome-wide studies by PAT-ChIP coupled with NGS sequencing (PAT-ChIP-seq). The research project will be conducted as follow: i) improvement of chromatin extraction technique from FFPE samples; ii) setting of a procedure for the preliminary evaluation of chromatin quality; iii) genomic analysis setting using the new in-house NGS platform; iv) preliminary application of the revised PAT-ChIP procedure to the study of the modulation of the epigenomic profiles in murine models of different ages and/or subjected to different dietary regimens. |
| Data del bando | 16/11/2017 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
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| Paesi di residenza dei candidati |
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| Nazionalità dei candidati |
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| Sito web del bando | http://www.uniurb.it/assegnidiricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Urbino Carlo Bo – Dip. di Scienze Biomolecolari |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Urbino |
| Sito web | http://www.uniurb.it |
| amministrazione.reclutamento.pdoc@uniurb.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 22/12/2017 |
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| Come candidarsi | Other |