Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Un approccio genomico integrato per la comprensione delle basi trascrizionali dell'eterogeneità intratumorale nel cancro del pancreas umano |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | An integrative genomic approach to understand the transcriptional bases of intratumoral heterogeneity in human PDACs |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Questo progetto ha l'obbiettivo di caratterizzare aree morfologicamente distinte isolate da tumori pancreatici umani attraverso microdissezione, al fine di legare i diversi fenotipi, programmi trascrizionali e profili epigenomici da una parte con le alterazioni mutazionali dall'altra. I circuiti regolatori identificati dalle analisi computazionali verranno validati usando approcci di editing genomico in linee cellulari. Per determinare le conseguenze funzionali e le implicazioni teraoeutiche della eterogeneità e specificamente per misurare le risposte adattive di diverse componenti del tumore alla terapia, useremo approcci genomici per analizzare aree tumorali morfologicamente definite di culture organotipiche esposte in vitro a diversi trattamenti farmacologici. |
Descrizione sintetica in inglese | This project aims at the systematic characterization of morphologically distinct tumor areas isolated from individual PDACs by laser capture microdissection, in order to link diverging phenotypes, transcriptional outputs and epigenomic profiles on the one hand with distinct mutational landscapes on the other. Regulatory circuits identified by computationally mining transcriptional, epigenomic and mutational features will eventually be validated using genome editing approaches in cancer cell lines. Finally, to determine functional correlates and therapeutic implications of heterogeneity, and specifically to measure the adaptive responses of distinct PDAC components to therapy, we will use integrative genomic approaches to analyze morphologically defined tumor areas from organotypic PDAC cultures exposed in vitro to multiple pharmacological treatments. |
Data del bando | 04/12/2017 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://www.hunimed.eu/it/lavora-con-noi/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Importo annuale | 35000 |
Valuta | Euro |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 36 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Expertise documentata da precedenti pubblicazioni nella analisi di data set genomici usando approcci di sequenziamento genomico (RNA-seq, ChIP-seq e saggi di accessibilità della cromatina) |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | Expertise documented by prior publications in the analysis of genomic datasets using Next Generation Sequencing approaches (RNA-Seq, ChIP-seq and accessibility assays) |
Nome dell'Ente finanziatore | Humanitas University |
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Tipologia dell'Ente | Academic |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Pieve Emanuele - Milano |
Sito web | https://www.hunimed.eu/it/ |
ufficiodocenti@hunimed.eu |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 19/12/2017 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it/humanitas/2017ar07/ |