Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Tecnologie di “Next Generation Sequencing” (NGS) per la caratterizzazione della risposta immune |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Next Generation Sequencing |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
| Descrizione sintetica in italiano | La risposta immune è tradizionalmente studiata con quantificazione di anticorpi specifici, analisi della risposta cellulare e della secrezione di citochine.L’analisi del trascrittoma con tecniche di NGS è un approccio innovativo. Esse possono essere utilizzate su campioni di RNA per quantificare l’espressione genica(RNA-seq).L’analisi dei dati di NGS-con strumenti bioinformatici quali il programma R/Bioconductor e i pacchetti sviluppati per l’analisi dei dati trascrittomici (RNA sequencing-permetterà di individuare l’attivazione di particolari pattern genici e di correlarli alla risposta immune.Saranno individuati i geni differenzialmente espressi nei soggetti vaccinati o infetti e verranno costruite delle reti di geni coespressi associate o meno alla presenza di particolari condizioni cliniche e a reazioni avverse.All’interno di queste reti verranno individuati i geni biomarcatori di reattogenicità |
| Descrizione sintetica in inglese | The immune response is traditionally studied by quantification of specific antibodies, cell response and cytokine secretion analysis. Transcriptome analysis using next-generation sequencing is rapidly becoming a core technology in the characterization of the immune response to infections and vaccines by sequencing and quantification of RNA messengers (RNA-seq). NGS data analysis will enable the detection of the activation of specific gene patterns and correlate them to the immune response. Data will be analyzed using the R / Bioconductor software environment with specific packages developed for RNA sequencing. Data analysis will identify differentially expressed genes in vaccinated/infected subjects compared to control individuals. Nets of coexpressed genes will be identified and associated to clinical conditions and adverse events in order to identify biomarker genes. |
| Data del bando | 12/01/2018 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| E' richiesta mobilità internazionale? | no |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
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| Paesi di residenza dei candidati |
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| Nazionalità dei candidati |
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| Sito web del bando | http://albo.unisi.it/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | SIENA |
| Sito web | http://WWW.UNISI.IT |
| amministrazione.dbm@unisi.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Other |
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| Data di scadenza del bando | 01/02/2018 |
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