Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Dinamica computazionale in ambiente confinato dei complessi biologici legati alle malattie neurodegenerative |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational dynamics under confinement of biological complexes related to neurodegenerative diseases |
Campo principale della ricerca | Chemistry |
Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | CHIM/07 - FONDAMENTI CHIMICI DELLE TECNOLOGIE |
Descrizione sintetica in italiano | La ricerca intende sviluppare metodi numerici avanzati per studiare le interazioni tra i componenti fondamentali (proteine, peptidi, leganti) dei complessi biologici in strutture di oro nanoporoso e comprendere i meccanismi molecolari alla base delle malattie neurodegenerative. Si richiedono competenze di dinamica e docking molecolare, modellazione dell’omologia, descrizione di forze intermolecolari, calcolo di energia libera, e determinazione delle proprietà di biomolecole coinvolte in sclerosi multipla e Alzheimer. Si richiede profonda esperienza nell’utilizzo di codici di simulazione come NAMD e Amber, nella scrittura di codici, e nell’uso del calcolo ad alte prestazioni. Si richiedono esperienza nel settore degli studi biologici, pubblicazione di risultati in riviste scientifiche specialistiche con revisione tra pari, comprovata capacità di interazione con ricercatori sperimentali, abilità di scrittura e comunicazione in inglese |
Descrizione sintetica in inglese | Our research aims at developing and applying state-of-the-art computational techniques to determine properties governing the interaction between the components (protein, peptide, ligands) of biological complexes confined in nanoporous gold structures, which are important to understand the molecular mechanisms of neurodegenerative diseases. Expertise in molecular dynamics (MD) simulations, binding free energy calculations of bio-molecular systems relevant to Multiple Sclerosis and Alzheimer’s diseases, is mandatory. Experience with MD packages such as NAMD and running simulations on high-performance computing clusters is required. Interest in biological problems and ability to interact with experimentalists are required. Prior publication in peer-reviewed scientific journals of articles on the subject is essential. Writing and communication skill in English as well as independent thinking and willingness to collaborate are essential |
Data del bando | 22/01/2018 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | http://dirpersonale.unica.it/concorsi/?page=assegni&bando=772 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Ingegneria meccanica, chimica e dei materiali |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Cagliari |
Sito web | https://www.unica.it/unica/it/dip_ingmeccanica.page |
francesco.delogu@dimcm.unica.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 12/02/2018 |
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Come candidarsi | Other |