Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di pipeline innovative per analisi di dati di Next Generation Sequencing (finanziamento MIUR Dipartimenti di Eccellenza 2018-2022 - Per il Dipartimento di Scienze Mediche) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of innovative pipelines for Next Generation Sequencing data analysis |
Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Il sequenziamento massivo parallelo di nuova generazione (NGS) genera un’enorme quantità di dati grezzi che richiedono analisi complesse prima di poter essere interpretati. Questa complessità rende difficile standardizzare il trattamento dei dati, soprattutto in un contesto accademico dove spesso uno studio richiede analisi ad hoc e metodi innovativi per trovare risposta a domande sempre diverse. L’assegno prevede lo sviluppo e la manutenzione di pipeline per la pulizia, elaborazione, annotazione ed interpretazione di dati NGS, sia genomici che trascrittomici. Riguardo ai dati genomici, in particolare dati ottenuti dal sequenziamento di esomi, gli obiettivi sono la chiamata e l’annotazione di varianti sia puntiformi che strutturali e la predizione di patogenicità. Riguardo ai dati trascrittomici, in particolare ottenuti dal sequenziamento di small non-coding RNA, gli obiettivi sono la quantificazione delle isoforme e l’analisi delle differenze di espressione. |
Descrizione sintetica in inglese | Next generation massively parallel sequencing (NGS) generates a tremendous amount of raw data that requires complex analysis before it can be interpreted. This complexity makes it difficult to standardize data processing, especially in an academic context where a study often requires ad hoc analyzes and innovative methods to find answers to ever-changing questions. The project comprises the development and maintenance of pipelines for cleaning, processing, annotation and interpretation of NGS data, both genomic and transcriptomic. With regard to genomic data, in particular data obtained from whole-exome sequencing, the objectives are the calling and the annotation of both small and structural variants and the prediction of pathogenicity. With regard to transcriptomic data, in particular obtained from the sequencing of small non-coding RNA, the objectives are the quantification of isoforms and differential expression analysis. |
Data del bando | 12/04/2018 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 20353 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Altri costi in italiano | \ |
Altri costi in inglese | \ |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando (n. rep. 1184 del 12/04/2018), modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione e i requisiti sono disponibili su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call (n. rep. 1184 - 12/04/2018), the requirements and how to apply are available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio (il calendario dei colloqui viene pubblicato entro la data di scadenza del bando. I candidati NON riceveranno comunicazione di ammissione al colloquio) |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) - Dates and venues of the interviews are published on the website of the University of Turin at the official notice board (https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/) by the date of the deadline |
Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Turin |
Sito web | http://www.unito.it/ |
assegniricerca@unito.it | |
Telefono | 0 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 03/05/2018 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it |