Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | MetaClin: una pipeline metagenomica per l'analisi degli ambienti ospedalieri |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | MetaClin: A metagenomics pipeline for the analysis of Hospital Environments |
Settore Concorsuale | 01 - Scienze matematiche e informatiche |
S.S.D | INF/01 - INFORMATICA |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto intende studiare una pipeline per affrontare il problema di infezioni impreviste nelle strutture cliniche e ospedaliere. L'approccio proposto è basato su moderne tecniche bioinformatiche di analisi metagenomica. In particolare, vogliamo studiare le complesse comunità microbiche costituite da batteri, virus e altri microrganismi che costituiscono il microbioma di un determinato campione prelevato da superfici, strumenti e prese d'aria di vari ambienti clinici che vanno dal pronto soccorso ai vari reparti. Sebbene ci siano alcuni problemi derivanti dall'estrazione e dal sequenziamento di DNA e RNA in tali contesti, i problemi e le sfide scientifiche principali sono computazionali. Le tecniche che verranno prese in considerazione includono strumenti per la profilazione di dati di sequenziamento dell'amplicone (16S e 18S rRNA, ITS), metagenomica shotgun e metatrascittomica |
Descrizione sintetica in inglese | The project intends to study a pipeline to address the problem of unexpected infections in clinical and hospital facilities. The proposed approach is based on modern bioinformatic techniques of metagenomic analysis. In particular, we want to study the complex microbial communities made up of bacteria, viruses and other microorganisms constituting the microbiome of a certain sample taken from surfaces, tools and air intakes of various clinical environments ranging from the emergency room to the various wards. Although there are some problems deriving from the extraction and sequencing of DNA and RNA in such contexts, the main problems are computational. The techniques that will be considered include tools for profiling amplicon sequencing data (16S and 18S rRNA, ITS), shotgun metagenomics and metatranscriptomics |
Data del bando | 27/06/2018 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 23787.00 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://www.unict.it/bandi/ricerca-e-trasferimento-tecnologico/assegni-di-ricerca-tipo-a |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367.00 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
Dottorato di Ricerca, o titolo equivalente conseguito all’estero, su tematiche attinenti al settore scientifico-disciplinare INF/01 “Informatica”, con curriculum scientifico professionale idoneo all’attività di ricerca. Conoscenza della lingua Inglese |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Catania |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Catania |
Codice postale | 95131 |
Indirizzo | Piazza Università, n. 2 |
Sito web | https://www.unict.it/ |
medclin@unict.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 18/07/2018 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |