Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Identificazione di proteine che interagiscono con il biofilm mediante phage display |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Biofilm-interacting proteins identification by phage display |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA |
Descrizione sintetica in italiano | In questo progetto la piattaforma di discovery che abbiamo sviluppato sarà applicata l'identificazione e l'analisi dei domini di proteine di B. multivorans C1576 che legano il biofilm. La procedura inizialmente utilizzerà un reporter su scala genomica per selezionare tutti i domini proteici correttamente ripiegati codificati nel genoma di B. multivorans C1576. Una volta generata, la qualità e la diversità della libreria genomica sarà valutata mediante sequenziamento massivo. I frammenti selezionati verranno quindi clonati in un apposito vettore per la creazione di una libraria “phage display” che sarà sottoposta a selezione su matrice di biofilm derivante da C1576. I fagi risultanti dalla selezione saranno analizzati mediante sequenziamento massivo per fornire informazioni per l'annotazione di geni contenenti domini con proprietà di legame specifiche. Infine, le proteine identificate saranno clonate ed espresse come proteine ricombinanti per ulteriori convalide |
Descrizione sintetica in inglese | The discovery strategy platform we have developed will be applied for the selection, identification and analysis of B. multivorans C1576 biofilm-binding protein domains. The procedure will initially use a folding reporter on a genomic scale to select all well folded protein domains encoded in the genome of B. multivorans C1576. Once generated, the quality and diversity of genomic library will be assessed by next generation sequencing. Selected fragments will then be cloned within a phage display context and the library subjected to selection on C1576 biofilm matrix and purified polysaccharides using ELISA assays. The phages resulting from the selection will be analyzed by deep sequencing to provide information for the annotation of genes containing domains with specific binding properties. Finally, putative binding proteins will be cloned and expressed as recombinant proteins for further validation |
Data del bando | 28/06/2018 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | http://web.units.it/concorsi/ricerca/assegni-ricerca/pub |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Importo annuale | 21169 |
Valuta | Euro |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Trieste |
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Tipologia dell'Ente | Academic |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Trieste |
Sito web | http://www.units.it |
concorsidoc@amm.units.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 27/07/2018 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |