Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Un approccio di systems biology per l’esplorazione dei tratti fenotipici delle singole miofibre |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | A systems biology framework for exploring phenotypic traits of single myofibers |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’obbiettivo di questo progetto è lo sviluppo di strumenti computazionali per i) investigare profili di espressione alla ricerca di firme di funzioni biologiche note, ii) suggerire nuove interazioni tra geni codificanti proteine e RNA non codificanti e iii) presentare tali risultati graficamente. Consolideremo dati da diverse risorse pubbliche in una singola collezione di interazioni regolative. Utilizzeremo la teoria statistica dei modelli grafici gaussiani per identificare moduli delle reti che correlano significativamente con i cambiamenti di espressione associati ai diversi tipi di fibre. Il risultato finale di questa analisi conterrà sia interazioni validate che inferite (miRNA-bersagli e miRNA-lncRNA), che collettivamente appariranno guidare la conversione metabolica delle miofibre. Svilupperemo infine un database web per i) rappresentare graficamente le reti ricostruite e ii) confrontare i risultati con altre condizioni del muscolo scheletrico incluse patologie. |
Descrizione sintetica in inglese | The objective of this project is the development of computational tools to i) query expression profiles for patterns related to well-known biological functions, ii) suggest novel interactions among protein-coding genes and non-coding RNAs and iii) to represent results graphically. We will consolidate multiple resources into a unified collection of known regulatory interactions. We will use the statistical theory of Gaussian Graphical Models to identify network modules which significantly relate to expression changes between different fiber types. The final output of this two-step analysis will contain both validated and inferred interactions (miRNA-target and miRNA-lncRNA), which collectively will appear to drive the metabolism shift in myofibers. We will finally develop a web database to i) represent graphically the reconstructed networks and ii) compare results with other conditions of the skeletal muscle including pathologies. |
Data del bando | 22/10/2018 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | https://www.biologia.unipd.it/dipartimento/bacheca-di-dipartimento/visualizza/?tx_ttnews%5Btt_news%5D=2779&cHash=094b5b9c0351c4f7c75fe7cf47a5c687 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova- Dip.to Biologia |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Padova |
Sito web | https://www.biologia.unipd.it/ |
direzione.biologia@unipd.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 06/11/2018 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |