Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Caratterizzazione genomica, profili di nuovi antigeni e impatto biologico dell’inattivazione di geni del MMR in cellule tumorali |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Genomic landscapes, neoantigen profiles and biological impact of MMR genes inactivation in cancer cells |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Nei tumori al colonretto, gastrici, endometriali ed altri tipi la perdita del meccanismo di riparazione del DNA (MMR) porta ad un aumento del numero di variazioni di singoli nucleotidi e inserzioni/delezioni, di quest’ultime alcune generano nuovi epitopi. Vogliamo studiare come il genoma murino ed umano di linee cellulari di cancro al colonretto (CRC) è influenzato dall’inattivazione del MMR. In parallelo, valuteremo se l’inattivazione del MMR genera neo-antigeni condivisi. Per fare ciò, inzialmente procederemo ad inattivare i geni del MMR (come MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, ecc) in linee cellulari di cancro umano e murino. Saranno eseguiti sequenziamenti di intero genoma e/o esoma, ed anche RNAseq sulle cellule ingegnerizzate. Infine, saranno eseguite analisi bioinformatiche per identificare possibili nuovi antigeni utilizzando metodologie computazionali che abbiamo recentemente sviluppato (Germano et al 2017; Corti et al 2018). |
| Descrizione sintetica in inglese | In colorectal, gastric, endometrial and other tumor types loss of DNA mismatch repair (MMR) leads to increased number of single nucleotide variant (SNV) and indels, some of the latters generate neoepitopes. We plan to study how the genome of mouse and human colorectal cancer (CRC) cells is influenced by inactivation of MMR. In parallel, we will assess whether inactivation of MMR leads to generation of shared neoantigens. To this end we will first perform genetic inactivation of MMR genes (such as MLH1, MSH2, MSH6 PMS2, etc) in mouse and human cancer cells. Whole genome sequencing (WGS) and/or Whole exome sequencing (WES), and RNASeq will then be performed on the genetically engineered cells. Finally bioinformatic analyses will be performed to identify putative neoantigens using ad hoc computational methodologies we recently developed (Germano et al 2017; Corti et al 2018). |
| Data del bando | 15/05/2019 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
| Importo annuale | 19367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
| Comprende il costo della ricerca | yes |
| Altri costi in italiano | \ |
| Altri costi in inglese | \ |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 36 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Il bando (pubblicato sull'Albo d'Ateneo al n. rep. 1787 del 15/05/2019) contenente modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione e i requisiti è disponibile su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call (pubblished on Albo d'Ateneo n° rep. 1787) with requirements and how to apply is available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio (il calendario dei colloqui viene pubblicato entro la data di scadenza del bando sull'Albo d'Ateneo https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo. I candidati NON riceveranno comunicazione di ammissione al colloquio). La domanda deve essere presentata tramite la procedura online https://pica.cineca.it/ |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) - Dates and venues of the interviews are published on the website of the University of Turin at the official notice board (https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/) by the date of the deadline. The application must be presented by online procedure in the site https://pica.cineca.it/ |
| Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Turin |
| Sito web | http://www.unito.it/ |
| assegniricerca@unito.it | |
| Telefono | 0 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 05/06/2019 - alle ore 00:00 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://pica.cineca.it |