Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studi di dinamica molecolare per la simulazione di permeazione e gating di canali ionici K2P in condizioni fisiologiche |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular dynamics studies for the simulation of permeation and gating of K2P channels under physiological conditions |
Campo principale della ricerca | Chemistry |
Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto di ricerca è volto allo sviluppo ed applicazione di approcci computazionali specifici per lo studio di permeazione e gating di canali K2P. Il metodo di elezione per lo sviluppo del progetto è la dinamica molecolare abbinata a protocolli simulativi che consentano lo studio di questi canali in condizioni prossime a quelle fisiologiche. I protocolli impiegati verranno applicati per lo studio del canale TRAAK (TWIK-related Arachidonic Acid K+ channel). In particolare, sarà studiata la permeazione di TRAAK: i) in condizioni simmetriche di potassio ([K+]in/out ˜ 100 mM, controllo) e asimmetriche ([K+]in ˜ 100 mM, [Na+]in ˜ 10 mM, [K+]out ˜ 10 mM, [Na+]out ˜ 100 mM), a diversi potenziali di membrana, per i principali modelli di conduzione di K+ (meccanismo “KWK” e “KK”); ii) in condizioni di stretching di membrana, al fine di simulare uno dei noti meccanismi di attivazione di TRAAK. |
Descrizione sintetica in inglese | The aims of the project are the development and application of specific computational approaches to study permeation and gating of K2P ion channels. The main method on which the project is based is molecular dynamics complemented with simulation protocols suitable to the study of these channels under quasi-physiological conditions. The protocols will be applied to the study of the TRAAK channel (TWIK-related Arachidonic Acid K+ channel). In particular, the permeation of TRAAK will be studied: i) under potassium symmetrical ([K+]in/out ˜ 100 mM, control) and asymmetrical ([K+]in ˜ 100 mM, [Na+]in ˜ 10 mM, [K+]out ˜ 10 mM, [Na+]out ˜ 100 mM) conditions, at different membrane potentials, for the main K+ conduction models (“KWK” and “KK” mechanisms); ii) under membrane stretching conditions, in order to simulate one of the known TRAAK activation mechanisms. |
Data del bando | 17/05/2019 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://www.aricweb.unibo.it/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Bologna |
Sito web | http://www.unibo.it |
maurizio.recanatini@unibo.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 04/06/2019 |
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Come candidarsi | Other |