Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi bioinformatica di dati da RNA-seq, ATAC-seq e risequenziamento del genoma per lo studio del ciclo vitale delle diatomee |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Bioinformatic analysis of RNA-seq, ATAC-seq and genome re-sequencing data far the study of the diatom life cycle. |
| Campo principale della ricerca | Biological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Biology |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA |
| Descrizione sintetica in italiano | Le diatomee sono microalghe eucariotiche responsabili del 20% della fissazione globale di CO2, ubiquitarie in habitat acquatici. Il sesso nelle diatome è regolato da processi endogeni e segnali esterni, ma i meccanismi coinvolti sono ignoti. Il progetto si incentra su Pseudo-nitzschia multistriata, specie modello per lo studio dei cicli vitali e genetica di popolazione. Gli obiettivi includono la definizione dei controlli trascrizionali ed epigenetici che orchestrano le transizioni del ciclo vitale, e degli effetti della riproduzione sessuale sull'evoluzione del genoma. Verranno raccolti dati di genomica di popolazione, il candidato dovrà identificare le variazioni e indagare il loro impatto nelle dinamiche di popolazione. Il candidato analizzerà anche altri dati NGS tra cui RNA-seq, ATAC-seq e risequenziamento del genoma. É' necessario possedere dimostrata esperienza con gli strumenti bioinformatici necessari per queste analisi |
| Descrizione sintetica in inglese | Diatoms are eukaryotic microalgae responsable far 20% ofthe global carbonfìxation, ubiquitous in aquatichabitats. Diatom sex,is regulated by endogenous processes and external cues, but the detailed mechanisms involvedare unknown. The research project focuses on Pseudo-nitzschia mu/Uslriata, a model spccics for the study of !ife cycles and population genelics. The project objectives include the definition of the transcriptional and epigenetic controls orchestrating life cycle transitions, and the assessment of the effects of sexual reproduction on genome evolution. Population genomics data will be collected and the candidate is expected to identify variations and investigate their impact in regulation and population dynamics. The candidate will also analyze other NGS data including RNA-seq, ATAC-seq and genome re-sequencing. Demonstrated experience with bioinformatic tools required for these analyses is mandatory |
| Data del bando | 26/06/2019 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Stanziamento annuale (indicativo) | 24000 |
| Periodicità | 12 mesi |
| E' richiesta mobilità internazionale? | no |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | http://www.szn.it/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | no |
| Importo annuale | 19540 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 36 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
a) Titolo di studio: diploma di laurea vecchio ordinamento secondo la normativa precedente al D.M. 509/99, oppure laurea specialistica/magistrale (D.M. 5/5/2004) in Biologia, Scienze biologiche, Biotecnologie, Bioinformatica, Biologia marina, Informatica, Chimica farmaceutica o similari o titolo equivalente conseguito all’estero; b) Dottorato di ricerca inerente il tema o tesi di Dottorato già consegnata; c) Almeno 1 pubblicazione su riviste ISI; d) Conoscenza della lingua inglese |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) |
a) Degree: university degree according to the law preceding the Ministerial Decree 509/99, or specialist degree (D.M. 5/5/2004) in Biology, Biological Sciences, Biotechnology, Bioinformatics, Marine Biology, Computer Science, Pharmaceutical Chemistry or the like or equivalent qualification obtained abroad; b) PhD concerning the PhD thesis or topic already delivered; c) At least 1 publication in ISI journals; d) Knowledge of English |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli, pubblicazioni e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all'esame dei titoli, teso ad accertare la competenza scientifico professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda. |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Competition for titles, publications and interview. The comparative evaluation of the candidates will be carried out by a special selection board, which will proceed with the examination of the qualifications, aimed at ascertaining the professional scientific competence of the candidate, as well as his aptitude to carry out the specific research object of the application. |
| Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zooligica Anton Dohrn (Fondi esterni) |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Napoli |
| Codice postale | 80121 |
| Indirizzo | Villa Comunale |
| Sito web | http://www.szn.it |
| gabriele.procaccini@szn.it | |
| Telefono | 0815833363 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 18/07/2019 |
|---|---|
| Come candidarsi | ufficio.protocollo@cert.szn.it; stazione.zoologica@szn.it |