Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Messa a punto di procedimenti bioinformatici per l'integrazione di dati -omics nelle malattie umane |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Setting bioinformatics pipelines for -omics data integration in human diseases |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’NGS è sempre più utilizzata per ottenere dati su DNA e RNA in linee di cellule e campioni di tessuto umani. Questi dati descrivono l'attività genomica nelle malattie umane e fondano la medicina personalizzata. Un problema chiave in questo campo è l’integrazione dei dati, cioè lo sviluppo di algoritmi capaci di canalizzare informazioni genomiche, epigenomiche, trascrittomiche, proteomiche ecc. disponibili in archivi pubblici, al fine di supportare e aumentare il significato di nuovi dati analitici. Proponiamo lo sviluppo di pipeline di integrazione di dati riguardanti le più innovative conoscenze di biologia molecolare: trascrittoma non codificante, trascritti alternativi circRNA inclusi, modificazioni epigenetiche e regolazione post-trascrizionale (miRNA, RBP). Questa pipeline sarà implementata per: 1) scoperta di biomarcatori umani e microbici in Cancro del colon-retto; 2) prioritizzazione delle varianti nel caso di una malattia rara, cioè il carcinoma surrenale. |
Descrizione sintetica in inglese | NGS is increasingly used to obtain DNA, RNA sequence data in human cell lines and tissue samples. This data features genomic activity in human diseases and grounds personalized medicine. One key issue in this field is “data integration”, i.e. developing algorithms able to channel information from genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics and other data available in public repositories, in order to support and augment the significance of novel experimental data. The present project deals with development of data integration pipelines that will take into account the most novel molecular biology knowledge, e.g. the noncoding transcriptome, alternative transcripts including circRNAs, epigenetic modifications and post-transcriptional regulatory events, such as miRNAs and RNA Binding Proteins. This pipeline will be implemented for: 1) human and microbial biomarkers discovery in Colorectal Cancer and 2) variant prioritization in the case of a rare disease, i.e. Adrenal Cancer. |
Data del bando | 10/09/2019 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Altri costi in italiano | \ |
Altri costi in inglese | \ |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Il bando (pubblicato sull'Albo d'Ateneo al n. rep. 3465 del 01/10/2019) contenente modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione e i requisiti è disponibile su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call (pubblished on Albo d'Ateneo n° rep. 3465) with requirements and how to apply is available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio (il calendario dei colloqui viene pubblicato entro la data di scadenza del bando sull'Albo d'Ateneo https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo. I candidati NON riceveranno comunicazione di ammissione al colloquio). La domanda deve essere presentata tramite la procedura online https://pica.cineca.it/ |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) - Dates and venues of the interviews are published on the website of the University of Turin at the official notice board (https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/) by the date of the deadline. The application must be presented by online procedure in the site https://pica.cineca.it/ |
Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Turin |
Sito web | http://www.unito.it/ |
assegniricerca@unito.it | |
Telefono | 0 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 01/10/2019 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it |