Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Il viroma intestinale come innesco per le Malattie Infiammatorie Croniche Intestinali (IBD): dalla metagenomica alla patogenesi |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Gut virome as a trigger for chronic intestinal inflammatory diseases (IBD): from metagenomics to pathogenesis |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Tra le specie che popolano il microbiota intestinale, il ruolo della componente virale, e in particolare dei virus eucariotici, necessita di ulteriori approfondimenti. Esistono evidenze sperimentali che indicano che in pazienti affetti da IBD nei primi stadi della sua progressione, la mucosa intestinale è caratterizzata dalla presenza di due specifiche famiglie virali, quella degli Hepeviridae nel CD e degli Hepadnaviridae in UC. Per questo, obiettivo del programma di ricerca è quello di studiare sia quali tipi cellulari della mucosa intestinale siano coinvolti, sia quali processi molecolari siano influenzati da tali infezioni nei primi stadi della malattia. |
| Descrizione sintetica in inglese | We have experimental evidence indicating that in patients with IBD in the early stages of its progression, the intestinal mucosa is characterized by the presence of two specific viral families, that of the Hepeviridae in the CD and the Hepadnaviridae in UC. For this reason the project aims at a comprehensive single cell metagenomic analysis on gut mucosae from treatment-naïve young patients with IBD at their first diagnosis to discover which cells are affected by eukaryotic viruses in the initial phases of IBD and how they can influence the whole mucosa’s immune response, eventually leading to chronic intestinal inflammation. |
| Data del bando | 21/11/2019 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Periodicità | 12 months |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://www.hunimed.eu/it/lavora-con-noi/#posizioni-a-tempo-determinato |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
|---|---|
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
Possono partecipare alla selezione coloro che, al momento della presentazione della domanda, risultano in possesso dei seguenti requisiti: 1) Laurea Magistrale in Bioinformatica, Informatica, Biologia computazionale oppure in una disciplina quantitativa simile; 2) Master ovvero Dottorato di ricerca in Bioinformatica, Biologia Computazionale, Genomica, Biologia medica (con componenti sostanziali in matematica, fisica, informatica o informatica) oppure Biologia (con componenti sostanziali in bioinformatica, informatica, matematica e statistica); 3) Curriculum scientifico e professionale idoneo allo svolgimento dell’attività di ricerca oggetto del presente bando. |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | In order to be considered for the post candidates must hold a Masters’ Degree in a quantitative field (e.g. Bioinformatics, Computer Science, Computational biology or similar quantitative discipline) and a Master Diploma or PhD in bioinformatics/computational biology, genomics, medical biology (with substantial components in mathematics, physics, computer science or information technology), or biology (with substantial components in bioinformatics, computer science, mathematics and statistics). |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) |
I criteri di valutazione sono predeterminati dalla Commissione in relazione all’oggetto dell’attività di ricerca. In particolare la Commissione terrà conto del possesso dei seguenti requisiti: • Comprovata esperienza in biologia integrativa, analisi di dati di sequenziamento NGS, analisi RNAseq a singola cellula (scRNAseq), programmazione bioscientifica, elaborazione e analisi di dati omici su larga scala; • Disponibilità all'apprendimento e allo sviluppo di nuovi strumenti e condotte per l'analisi e la visualizzazione di serie di dati di espressione genica; • Esperienza nel cluster di elaborazione ad alte prestazioni e con almeno uno dei seguenti linguaggi di programmazione: C ++, Perl, Python, JAVA, R o script di shell e database relazionali; • Competenza operativa in UNIX / Linux. |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) |
Selection criteria are predetermined by the Selection Committee. As part of the selection process, the Committee will evaluate the curriculum, titles and publications presented by the candidate and will consider, in particular: - Previous experience in integrative biology, next-generation sequencing (NGS) data analysis, single cell RNAseq analysis, bioscientific programming, and processing and analysis of large-scale omics data; - Willingness to learn and develop novel pipelines and tools to analyze and visualize gene expression data sets; - Experience in high performance computing cluster would be a plus; - Experience with at least one of the following programming language: C++, Perl, Python, JAVA, R or shell scripting and relational databases. - Working proficiency in UNIX/Linux. |
| Nome dell'Ente finanziatore | Humanitas University |
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| Tipologia dell'Ente | Academic |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Pieve Emanuele |
| Sito web | https://www.hunimed.eu/it/lavora-con-noi/#posizioni-a-tempo-determinato |
| ufficiodocenti@hunimed.eu |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 12/12/2019 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://www.hunimed.eu/it/lavora-con-noi/#posizioni-a-tempo-determinato |