Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio della traslocazione molecolare attraverso membrane lipidiche mediante metodi per la simulazione di eventi rari |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular translocation across lipid membranes studied by long-timescale simulation methods |
| Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
| S.S.D | CHIM/02 - CHIMICA FISICA |
| Descrizione sintetica in italiano | Si intende studiare la traslocazione molecolare attraverso membrane lipidiche utilizzando tecniche per la simulazione di eventi rari. I processi di interesse sono la traslocazione di lipidi tra monostrati (flip-flop) e la permeazione di soluti attraverso la membrana. L’osservazione diretta e il campionamento di questi processi con simulazioni di Dinamica Molecolare (MD) richiedono traiettorie di lunghezza proibitiva. Negli ultimi anni sono stati sviluppati algoritmi efficienti per lo studio di processi lenti, basati sul campionamento di percorsi che connettono stati definiti opportunamente lungo la coordinata di reazione. I metodi noti come Transition Path Sampling, per eventi che richiedono il superamento di barriere elevate, e Forward Flux Sampling, adatto anche per processi di non equilibrio, appaiono adeguati per il flip-flop e la permeazione, rispettivamente. Si intende integrare questi metodi con pacchetti software per MD e studiare sistemi di rilevanza biologica e farmaceutica |
| Descrizione sintetica in inglese | We intend to study the molecular translocation across lipid membranes by novel simulation techniques for sampling of rare events. We will address the translocation of lipids between leaflets (flip-flop) and the membrane permeation of solutes. Direct observation and sampling of these processes by Molecular Dynamics (MD) simulations require prohibitively long trajectories. During the last years, effective algorithms for slow processes have been developed, based on the statistical sampling of paths connecting properly defined states along the reaction coordinate. Transition Path Sampling, for rare events involving the crossing of high free energy barriers, and Forward Flux Sampling, suitable also for driven processes in non-equilibrium systems, appear as the most promising for the case of flip-flop and permeation processes, respectively. We intend to integrate these methods with a software package for MD and to investigate selected systems of biological and pharmaceutical interest. |
| Data del bando | 13/03/2012 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | http://www.chimica@unipd.it |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | http://www.unipd.it |
| segreteria.chimica@unipd.it | |
| Telefono | 049 827 5298 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 29/03/2012 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |