Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Identificazione di SNP mediante tecnica EcoTILLING |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Identification of SNP through EcoTILLING |
Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’EcoTILLING è un a applicazione del TILLING utile per l’identificazione di variazioni naturali. Nel protocollo sperimentale del TILLING, una porzione genica di circa 1 Kb verrà amplificata con primer marcati con fluororori utilizzando come stampo un pool di DNA preparato da individui mutagenizzati. Pertanto un set di 30 genotipi con caratteristiche qualitative di pregio verrà utilizzato per l’identificazione di SNP in frumento duro, mediante EcoTILLING. Da ciascuna varietà di frumento duro sarà poi preparato il DNA genomico e questo opportunamente miscelato a quello di un campione di riferimento. In questo modo saranno quindi costituiti i campioni sui quali sarà effettuata la ricerca di SNP. Il disegno dei primer potrà realizzarsi sulla base delle sequenze nucleotidiche depositate in banca dati e/o identificate nell’ambito del progetto su geni di importanza per caratteristiche qualitative, in particolare ci si soffermerà su geni coinvolti nel metabolismo azotato. |
Descrizione sintetica in inglese | EcoTILLING is an application of TILLING strategy useful for identifying new natural allelic variations. In the TILLING protocol, a genic region of 1Kb is amplified with labeled primers using the pooled DNA of mutagenized plants. After an initial denaturation and re-annealing step of the PCR products, the single base mutations are identified through endonuclease CEL1 digestion. This enzyme recognizes the mismatches regions in the heteroduplexe structures. The digested and labeled PCR products are then analyzed on acrylamide gels. In the EcoTILLING the SNPs research is based on the genetic variability of natural population. Therefore a set of 30 genotypes characterized with high qualitative traits will been analyzed thought EcoTILLING strategy. The research will proceed with DNA extraction of each durum wheat cultivar will and its organization in pool with a DNA used as a reference. This will allow the creation of mismatches between DNA molecules. |
Data del bando | 22/03/2012 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
All |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.apd.ict.uniba.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | MIUR |
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Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Roma |
Sito web | http://www.miur.it |
agata.gadaleta@agr.uniba.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 26/04/2012 |
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Come candidarsi | Other |