Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di pipelines per la gestione di dati “omici” su cluster di calcolo |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of pipelines for omics data management in the High Performance Computing Cluster |
| Settore Concorsuale | 01 - Scienze matematiche e informatiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | A partire da dati di next generation sequencing (DNA/RNA) e proteomica (spettrometria di massa) ottenuti dal personale dei dipartimenti afferenti al CRIBI, verranno sviluppate delle pipelines per facilitare le analisi bioinformatiche. Lo sviluppo verrà attuato in maniera coordinata col personale tecnico preposto alla gestione del cluster e con il personale delle facilities di proteomica, next-gen sequencing e gene expression. Lo sviluppo delle pipelines è focalizzata all’integrazione di software e all’ottenimento di sistemi complessi di gestione delle risorse computazionali tramite Nextflow e Snakemake. |
| Descrizione sintetica in inglese | Starting from next generation sequencing data (DNA/RNA) and proteomics (mass spectrometry) data obtained by the staff of the departments associated to the CRIBI center, pipelines will be developed to facilitate downstream bioinformatics analyses. Development will be performed in a coordinated manner with the technical staff responsible for managing the computing cluster and with the staff of the proteomics, next-gen sequencing and gene expression facilities. The development of the pipelines is focused on software intergration to deliver complex systems for managing computational resources through Nextflow and Snakemake. |
| Data del bando | 10/09/2020 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | https://www.cribi.unipd.it/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | no |
| Importo annuale | 19.367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | La selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico– professionale, della produttività scientifica e di un colloquio. |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Candidates are selected by a comparative evaluation of their qualifications, academic and professional curriculum vitae, publications and an interview. |
| Nome dell'Ente finanziatore | Università di Padova - Centro di Ricerca Interdipartimentale per le Biotecnologie Innovative (CRIBI) |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | https://www.cribi.unipd.it/ |
| cribi@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 25/09/2020 - alle ore 00:00 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://pica.cineca.it/unipd/ |