Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Applicazione di tecniche computazionali per identificare e sviluppare nuovi chaperoni della rodopsina a partire da fonti naturali |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Application of computational techniques for the identification and development of novel rhodopsin pharmacological chaperones from natural sources |
| Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Il progetto è finalizzato alla identificazione di chaperoni della rodopsina sfruttando la diversità chimica dei prodotti naturali. Saranno applicati approcci di structure- e ligand-based virtual screening per trovare nuovi ligandi della rodopsina. Il fine ultimo sarà la identificazione di composti non-retinoidi capaci di legare la rodopsina mutata, tramite simulazioni di docking classico e covalente (che rappresenterà la tecnica maggiormente utilizzata). Le stesse tecniche saranno usate per la identificazione di ligandi di siti allosterici presenti sulla rodopsina. Il virtual screening verrà applicato a librerie di composti commercialmente disponibili, tipo la parte della banca dati ZINC dedicata ai composti naturali. Una volta identificati ed acquistati o sintetizzati, gli hit compounds saranno saggiati in saggi funzionali per confermare i risultati computazionali. |
| Descrizione sintetica in inglese | This research project will focus on the identification of rhodopsin pharmacological chaperones, by exploiting the large chemical diversity of natural products. Structure- and ligand-based virtual screening will be applied to discover novel rhodopsin binder candidates. The main goal is to identify non-retinoid compounds able to bind the retinal binding pocket of mutated rhodopsin, using both conventional docking and a new reactive docking protocol (as the major technique to be applied) for the identification of irreversible binders. Target potential allosteric sites using the same computational approach will be also studied. Commercially available libraries, as well as curated collections of natural compounds from ZINC (200-500k compounds), will be selected for the virtual screening. Functional assays will be utilized to confirm the computational results. |
| Data del bando | 22/09/2020 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | http://albo.unisi.it/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Siena |
| Sito web | http://www.unisi.it |
| amministrazione.dbcf@unisi.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 23/10/2020 |
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