Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Caratterizzazione di determinanti di resistenza antibiotica tramite sequenziamento ed analisi bioinformatica di genomi batterici |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Characterization of antibiotic resistance determinants in bacterial genomes by sequencing and bioinformatic analysis |
Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
S.S.D | MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
Descrizione sintetica in italiano | L’assegnista dovrà crescere ceppi batterici, isolarne il DNA e sequenziarlo utilizzando le tecnologie Illumina e Nanopore. Il DNA dovrà essere estratto utilizzando protocolli che ne conservino il più possibile l’integrità, in modo da ottenere sequenze lunghe (>100 kb) con il Nanopore sequencing. I genomi batterici dovranno essere assemblati e caratterizzati, con particolare riguardo per: (i) elementi genetici mobili, (ii) determinanti di resistenza acquisiti, (iii) mutazioni nel genoma “core”. |
Descrizione sintetica in inglese | The researcher will grow bacterial strains, isolate their DNA and perform sequencing using both Illumina and Nanopore technologies. DNA will be extracted using laboratory protocols specifically designed to preserve DNA integrity, in order to obtain long reads (>100 kb) when sequencing with Nanopore technology. Bacterial genomes will be assembled and characterized with special attention to: (i) mobile genetic elements, (ii) acquired antibiotic resistance determinants, (iii) muations in the core genome. |
Data del bando | 12/10/2020 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | Albo on-line | Università degli Studi di Siena - https://www.unisi.it › node |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Siena |
Sito web | https://www.unisi.it |
amministrazione.dbm@unisi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 31/10/2020 - alle ore 00:00 |
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