Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di un protocollo computazionale per il docking molecolare |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of a computational protocol for mulecolar docking |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Applied physics |
| Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Gli obiettivi del progetto di ricerca riguardano lo sviluppo di: i) un protocollo computazionale basato su metodi di campionamento avanzato delle configurazioni di proteine, per migliorare la predizione dei complessi proteine-molecole generiche; ii) un database di strutture di proteine di interesse farmacologico e un algoritmo automatico (accessibile tramite un’interfaccia web contenente il database di cui sopra) che utilizzi le suddette conformazioni nella predizione della struttura più probabile del complesso fra la relativa proteina e molecole di interesse per l’utente. È richiesta familiarità con le tecniche di docking molecolare, dinamica molecolare, analisi a clusters; scripting nei linguaggi bash, tcl, python; competenze informatiche sui database relazionali. Il titolare dell’assegno dovrebbe generare le configurazioni di circa venti proteine di interesse farmacologico, così da testare una prima versione del tool di cui al punto ii). |
| Descrizione sintetica in inglese | The goals of the research project are to develop: i) a computational protocol based on enhanced-sampling of protein conformations, in order to improve the prediction of their complexes with generic molecules; ii) a database of structures of proteins, as well as an automatic algorithm (accessible via a web interface containing the database) that employs the aforementioned conformations to predict the most probable structure of the complex between the protein and any substrate of interest. Familiarity is required with molecular docking, molecular dynamics, cluster analysis; scripting in bash, tcl, python; relational databases. The fellow should generate the conformations of about twenty proteins of pharmacological interest, so as to test a first version of the tool at point ii) |
| Data del bando | 16/12/2020 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | http://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Unica GE.SI.C |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | http://www.unica.it |
| vargiu@dsf.unica.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 05/01/2021 |
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| Come candidarsi | Other |