Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di protocolli di sequenziamento massivo di III generazione Oxford Nanopore Technologies per lo studio di genomi virali in ambito di medicina di precisione |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Implementation of Oxford Nanopore Technologies Third Generation Sequencing protocols for viral genomes analysis as a tool for precision medicine |
| Campo principale della ricerca | Medical sciences |
| Sottocampo della ricerca | Veterinary medicine |
| Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | La medicina di precisione si avvale di tecniche di next generation sequencing per diagnosi e prognosi accurate, nonché terapie mirate. In un ambito di medicina di precisione applicata in un contesto di laboratori del SSN, e replicabile in ambito veterinario, la ricerca è finalizzata alla messa a punto di protocolli di preparazione della library semplici, ripetibili, robusti e rapidi per il sequenziamento completo di Sars-CoV-2 mediante tecnica TGS ONT. La ricerca si basa sulla messa a punto di protocolli di amplificazione mediante multiplex PCR di genomi virali interi a partire da matrice complessa (acidi nucleici misti virali, batterici e umani) e con bassa/moderata carica virale. Lo studio prevede inoltre, l’analisi preliminare delle sequenze degli isolati mediante pipeline semplici basate su interfaccia grafica e non CLI, con valutazione qualitativa delle sequenze, assemblaggio della sequenza consenso ed identificazione dei polimorfismi virali. |
| Descrizione sintetica in inglese | Precision medicine relies on next generation sequencing techniques for accurate diagnosis and prognosis as well as for targeted therapies. To foster the precision medicine approach in National health Service public laboratory settings to be trasferred as such in Veterinary labboratories, the study will be aimed at implement protocols simply, rapid, robust and reproducible to prepare library to be sequenced using the Oxford Nanopore Technologies. Protocols will be based on targeted amplification using multiplex PCR with very long amplicons to obtain almost full-length viral genomes from complex matrices (viral+humans) with low/moderate viral loads. Furthermore, the study will include the evaluation of a preliminary analysis with Graphic interface users bioinformatic pipeline to obtain consensus sequence, polymorphism and sequence quality analysis. |
| Data del bando | 10/02/2021 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE VETERINARIE |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| amministrazione.vet@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 04/03/2021 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |