Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Design computazionale di frammenti di anticorpo |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational design of antibody fragments |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | CHIM/08 - CHIMICA FARMACEUTICA |
Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
S.S.D | FIS/07 - FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA) |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto mira a sviluppare e convalidare un metodo computazionale per la progettazione ex-novo di frammenti di anticorpo (noti come nanobodies o VHH) ignegnerizzati per essere selettivi verso biomarcatori e bersagli farmaceutici di natura proteica. Coinvolgerà principalmente l'uso e lo sviluppo di metodi basati sulla dinamica molecolare e sul Monte Carlo per introdurre e sviluppare nuove strategie per la progettazione e l'ottimizzazione dei VHH stessi. Il candidato/a dovrebbe essere in possesso di un dottorato di ricerca o equivalente in una materia pertinente, una comprovata esperienza nei linguaggi di scripting (BASH, PYTHON) e nelle tecniche standard di modellazione molecolare basate su simulazioni atomistiche, modelli di omologia, e docking. Si richiedono competenze in più tecniche, interesse ad apprendere quelle con cui non ha familiarità, alto livello di indipendenza, interesse a lavorare in un ambiente multidisciplinare, padronanza dell'inglese scritto/parlato. |
Descrizione sintetica in inglese | Goal of this project is to deliver a highly validated computational method for the ex-novo design of antibody fragments (known as nanobodies, or VHHs) engineered to be selective towards relevant protein biomarkers and pharmaceutical targets. The project will primarily involve the use and development of Molecular Dynamics and Monte Carlo based methods to introduce and develop novel strategies for the design and optimisation of VHHs. The ideal candidate for this position should hold a PhD or equivalent in a relevant subject and proven expertise in scripting languages (BASH, PYTHON) and standard molecular modelling techniques based on atomistic simulations, homology modelling, and docking. Competences in multiple techniques, interest in learning the ones she/he is not familiar with, and a high level of independence are an asset. Interest in working in a multidisciplinary environment and fluency in written/spoken English are mandatory. |
Data del bando | 23/03/2021 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | https://web.units.it/concorsi/ricerca/conc-41630 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Importo annuale | 21983 |
Valuta | Euro |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Trieste |
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Tipologia dell'Ente | Academic |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Trieste |
Sito web | https://www.units.it |
assegni@amm.units.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 26/04/2021 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it/units (rif. PICA 21ar359-9) |