Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Next generation sequencing (NGS) di coorti di pazienti COVID-19 (Progetto ORCHESTRA) |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Next generation sequencing (NGS) of COVID-19 patient cohorts (Project ORCHESTRA) |
| Campo principale della ricerca | Medical sciences |
| Sottocampo della ricerca | Medicine |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Campioni di pazienti con vari gradi di gravità COVID-19 saranno raccolti tramite le coorti ORCHESTRA e selezionati per l'analisi genomica del'nDNA / mtDNA dell'ospite. Un'analisi genetica approfondita dei 900 pazienti selezionati mediante sequenziamento dell'intero genoma (WGS) o dell'intero esoma (WES) sarà seguita da analisi funzionali delle varianti più promettenti. Le varianti a cui dare la priorità saranno selezionate in base alla loro frequenza e al loro impatto funzionale previsto da punteggi diversi. Condurremo un'analisi basata su coorte cercando un eccesso di pazienti COVID-19 portatori di varianti aggregate all'interno di un'unità genomica (ad esempio un gene) rispetto ai controlli. Quando possibile, campioneremo famiglie nucleari in cui i genitori e i figli infetti hanno mostrato vari gradi di sintomi per ricercare la variabilità intrafamiliare tenendo conto della gravità della malattia. I dati genomici verranno utilizzati anche per ottenere le CNV e i dati HLA. |
| Descrizione sintetica in inglese | Retrospective samples will be collected from the existing biobanking from patients with varying degrees of COVID- 19 severity via the ORCHESTRA cohorts and selected for analysis of host nDNA/mtDNA genomics (blood sample). In-depth genetic analysis of the 900 selected patients by whole genome (WGS) or whole exome sequencing (WES) will be followed by functional analyses of the most promising variants. Variants to be prioritized will be selected based on their frequency, and their functional impact predicted by different scores. We will conduct a cohort-based analysis by searching for an excess of COVID-19 patients carrying variants aggregated within a genomic unit (e.g. a gene) as compared with controls. When possible, we will sample nuclear families where infected parents and offspring displayed varying degrees of symptoms to capture transmitted intra-familial variability accounting for disease severity. Genomic data will also be used to obtain Copy Number Variants (CNVs) and HLA data. |
| Data del bando | 14/04/2021 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE E CHIRURGICHE |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| sam.nonstrutturati@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | H2020 |
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| Data di scadenza del bando | 28/04/2021 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |