Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | RiskCrohnBiom: Stratificazione del rischio in pazienti pediatrici con Morbo di Crohn attraverso l’analisi del microbioma intestinale. |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | RiskCrohnBiom: Risk stratification in pediatric Crohn’s disease patients through the analysis of gut microbiome profiles. |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/19 - MICROBIOLOGIA |
Descrizione sintetica in italiano | Le malattie infiammatorie croniche intestinali (MICI)sono patologie croniche ad eziologia multifattoriale(fattori genetici, immunologici e ambientali).L'incidenza delle MICI è in aumento in tutto il mondo, soprattutto nel mondo occidentale, e nella popolazione pediatrica. Le MICI sono caratterizzate da riacutizzazioni intermittenti della malattia che richiedono aggiustamenti nella terapia, ospedalizzazioni e interventi chirurgici. Il microbioma intestinale è noto avere un ruolo importantissimo nell’eziologia della malattia. Lo scopo del progetto è sviluppare marcatori diagnostici tramite analisi integrata del microbioma. . Il candidato estrarrà DNA genomico batterico e fungino. Per caratterizzare la composizione batterica intestinale il candidato eseguirà il sequenziamento degli ampliconi microbici del gene dell'RNA ribosomiale 16S (per i batteri) e della regione ITS (per i funghi) con piattaforma Illumina. Verrà eseguita un'analisi bioinformatica per lo sviluppo di marcatori. |
Descrizione sintetica in inglese | Inflammatory bowel diseases (IBD) are chronic inflammatory disorders with multifactorial etiology (genetic, immunological and environmental factors). The incidence of IBD is increasing worldwide, especially in western world and in pediatric population. IBD is characterized by intermittent flares of disease activity requiring adjustments in medication, hospitalizations and surgeries. We propose a metagenomic investigation of the gut bacterial and fungal communities, with the aim to use the microbiome as a novel biomarker for patient stratification. Bacterial and fungal DNA extraction, amplicon and sequencing by Illumina MiSeq platform and development of microbial biomarkers. The candidate will extract bacterial and fungal genomic DNA from faecal samples in order to perform metagenomic assays. For targeted fungal metagenomics the candidate will also establish standard operating procedures for enrichment and isolation of fungal cells from faecal matter. Targeted bacterial and fungal meta |
Data del bando | 29/09/2021 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 23786 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | https://titulus.unifi.it/albo/viewer?view=files%2F004245065-UNFICLE-149d4101-b6f2-4d54-9be4-553893ba6954-000.pdf |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 23786 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
Laurea Magistrale in: Biologia, Biotecnologie industriali, Biotecnologie mediche veterinarie e farmaceutiche Dottorato in scienze biologiche |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) |
Master Degree in: Biology, Industrial Biotechnology, Pharmaceutical veterinary medical biotecnology. PhD in biological sciences |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Il concorso è per titoli e per colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The competition will be carried out by an evaluation of titles and examination, by means of an interview |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli studi di Firenze- Dipartimento di Biologia |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Firenze |
Sito web | http://www.unifi.it |
selezioni@bio.unifi.it | |
Telefono | +390552757361 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 20/10/2021 |
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Come candidarsi | selezioni@bio.unifi.it |