Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi bioinformatiche e recupero informazioni rilevanti sulla diversità dal sequenziamento HTS di campioni ambientali frazionati di plancton dal Golfo di Napoli |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Bioinformatic analysis and retrieval of relevant diversity information from HTS sequencing of plankton fractionated environmental samples from the Gulf of Naples |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Biology |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
Descrizione sintetica in italiano | il progetto mira all'elaborazione e all'organizzazione di dataset di dati meta-barcoding, meta-trascrittomici e meta-genomici ottenuti presso siti di campionamento nel Golfo di Napoli, concentrandosi sulla diversità tassonomica e funzionale in diverse condizioni ambientali. I campioni sono già sequenziati e derivano da diverse crociere di campionamento in diversi siti del Golfo di Napoli. Il candidato deve trattare le sequenze grezze utilizzando strumenti standard e pipeline stabilite, in accordo con collaboratori interni ed esterni. Verranno affrontate diverse questioni scientifiche, comprese, ma non esclusivamente, le interazioni biotiche tra diatomee e batteri, i marcatori molecolari dei cicli vitali delle diatomee e i geni attivati in condizioni di limitazione dei nutrienti. È richiesta una comprovata esperienza con strumenti bioinformatici per l'analisi di dati omici e set di dati ambientali |
Descrizione sintetica in inglese | the project aims at processing and organizing of meta-barcoding, meta-transcriptomic and meta-genomic datas obtained at sampling sites in the Gulf of Naples, focusing on taxonomical as well as functional diversity in different environmental conditions. Samples are already sequenced and derive from several sampling cruises at different sites in the Gulf of Naples. The candidate is expected to treat the raw sequences using standard tools and established pipelines, in collaboration with internal and external collaborators. Several scientific questions will be tracckeld, including, but not exclusevely, the biotic interactions between diatoms and bacteria, fingerprints for diatom life cycle and activated genes in nutrient limiting conditions. Demonstrated experience with bioinformatics tools for analysis of omics data and environmental datasets is requested |
Data del bando | 04/10/2021 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 24000 |
Periodicità | 12 mesi |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
OTHER |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | http://www.szn.it/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | no |
Importo annuale | 19540 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
a) Titolo di studio: Diploma di laurea vecchio ordinamento secondo la normativa precedente al D.M. 509/99, oppure laurea specialistica/magistrale (D.M. 5/5/2004) in Scienze Biologiche, Scienze Naturali, Scienze Ambientali, Biotecnologie, Informatica, Bioinformatica o titolo equivalente conseguito all'estero; b) Titolo di Dottore di Ricerca o Tesi di Dottorato già consegnata in discipline pertinenti con la tematica del bando c) Almeno 1 pubblicazione su riviste ISI d) Conoscenza della lingua inglese |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) |
a) Italian degree diploma according to the law preceding the Ministerial Decree 509/99, or Italian master degree (D.M. 5/5/2004) in Biological Sciences, Environmental Sciences, Natural Sciences Biotechnologies, Informatics, Bioinformatics, or similar or equivalent qualification obtained abroad; b) PhD title or PhD thesis already submitted for evaluation in disciplines relevant to the topic of the call c) c) At least 1 publication on ISI journals d) d) Knowledge of English |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli, e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all'esame dei titoli, teso ad accertare la competenza scientifico professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Competition for titles, and interview. The comparative evaluation of the candidates will be carried out by a special selection board, which will proceed with the examination of the qualifications, aimed at ascertaining the professional scientific competence of the candidate, as well as his aptitude to carry out the specific research object of the application. |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica Anton Dohrn |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | Villa Comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
gabriele.procaccini@szn.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 29/10/2021 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | ufficio.protocollo@cert.szn.it; stazione.zoologica@szn.it |