Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Università di Firenze- Simulazioni computazionali della propagazione del potenziale d'azione in cuori di topo basati su ricostruzione strutturali ad alta risoluzione |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | University of Florence- Computational simulations of action potential propagation in mouse hearts based on high-resolution structural data- published on the |
Campo principale della ricerca | Engineering |
Sottocampo della ricerca | Biomedical engineering |
Settore Concorsuale | 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione |
S.S.D | ING-INF/06 - BIOINGEGNERIA ELETTRONICA E INFORMATICA |
Descrizione sintetica in italiano | Tecniche avanzate di schiarimento tissutale, immunoistochimica e microscopia ottica sono sfruttate per eseguire ricostruzioni 3D di cuori di topo interi con risoluzione micrometrica. Nel dettaglio, la tecnologia MESOspim viene sfruttata per ricostruire il miocardio e le aree di fibrosi in cuori murini. Il candidato svilupperà una pipeline di pre-elaborazione per registrare le immagini, unire i dati multicanale e deconvolvere i risultati. Poi, un software di analisi immagine mapperà i miofilamenti definendo le vie di conduzione della propagazione del potenziale d'azione a livello intercellulare. Il candidato integrerà questi dati strutturali ad alta risoluzione in una mesh 3D e applicherà modelli di propagazione del potenziale d'azione per simulare l'elettrofisiologia cardiaca e gli eventi aritmici, permettendo un confronto diretto tra le simulazioni computazionali e le registrazioni funzionali precedentemente acquisite sullo stesso cuore per mezzo della mappatura ottica. |
Descrizione sintetica in inglese | We are combining advances in tissue clearing, immunostaining and high-resolution optical microscopy to perform three-dimensional reconstructions of entire mouse hearts with micron-scale resolution. In detail, MESOspim technology is exploited to imaging myocardium and fibrosis area in control and pathological murine hearts. The candidate will develop a preprocessing pipeline act to register images, merge multichannel data, and deconvolve results. Then, a custom-made cytoarchitectonic analysis software will map myofilaments in three dimensions, defining the conduction pathways of action potential propagation at intercellular level. The candidate will integrate this high-resolution structural data in a 3D mesh and apply models of action-potential propagation to simulate cardiac electro-physiology and arrhythmia events, allowing a direct comparison between computational simulations and functional records previously acquired on the same heart by means of optical mapping. |
Data del bando | 27/10/2021 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://titulus.unifi.it/albo/viewer?view=files%2F004296799-UNFICLE-9b84eb6c-9115-4706-9521-ad243d868acd-000.pdf |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 25000 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | LM in ingegneria biomedica |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | biomedical engineering master degree |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | evaluation of title and examnation by means of an interview |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Firenze- Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Firenze |
Sito web | http://www.unifi.it |
amministrazione.dinfo@unifi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 22/11/2021 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |