Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | PRIN 2017 - Regolazione dell'espressione geniva nella vite: analisi dei determinanti genetici ed epigenetici |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | PRIN 2017 - Regulation of gene expression in grapevine: analysis of genetic and epigenetic determinants |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Le diverse manifestazioni fenotipiche nelle piante sembrano essere maggiormente determinate da variazioni nell’espressione genica rispetto a variazioni di sequenza. Pertanto, la comprensione del controllo dell'espressione genica diventa un prerequisito fondamentale per le future applicazioni delle tecniche di genome editing. Grazie all’evoluzione di tecniche di sequenziamento è oggi possibile implementare le conoscenze sulla regolazione genica: RNASeq per l'espressione genica, ATACSeq per l'accessibilità della cromatina, BSSeq per la metilazione del DNA, ChIPSeq per le modificazioni istoniche, DAPSeq per l’identificazione del sito di legame da parte del fattore di trascrizione. In questo progetto saranno identificati i siti di legame di fattori di trascrizione di vite utilizzando DAPseq in combinazione con dati ottenuti dall'analisi RNAseq. Gli esperimenti DAP-Seq saranno eseguiti su alcuni membri di tre importanti famiglie geniche di fattori di trascrizione: WRKY, MYB e NAC |
Descrizione sintetica in inglese | A large fraction of plant phenotypic variation appears to be determined by regulatory rather than coding variation. Therefore, the understanding how gene expression is controlled becomes a prerequisite for the exploitation of the full potential of genome editing techniques. Thanks to the discovery of the next generation sequencing (NGS), analysis methods have allowed to implement the knowledge on the gene regulation: RNASeq for gene expression, ATACSeq for chromatin accessibility, BSSeq for DNA methylation, ChIPSeq for histone modifications, DAPSeq for transcription factor binding site identification. In this project, the transcription factor binding site identification using the DAPseq will be analyzed and combined with data obtain by RNAseq analysis. DAP-Seq experiments will be performed on members of three important grapevine TF families: WRKY, MYB and NAC |
Data del bando | 03/11/2021 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.urp.cnr.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Nome dell'Ente finanziatore | CONSIGLIO NAZIONALE DELLE RICERCHE - ISTITUTO DI ANALISI DEI SISTEMI ED INFORMATICA |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | ROMA |
Codice postale | 00185 |
Indirizzo | VIA DEI TAURINI 19 |
Sito web | http://www.iasi.cnr.it |
segreteria@iasi.cnr.it | |
Telefono | 06 49937102 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 24/11/2021 |
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Come candidarsi | protocollo.iasi@pec.cnr.it |