Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo e applicazione di un protocollo computazionale per la predizione di strutture farmaco-proteina |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of a webserver to predict the structure of protein-ligand complexes of biomedical relevance. |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Applied physics |
| Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/07 - FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA) |
| Descrizione sintetica in italiano | Gli obiettivi del progetto di ricerca riguardano lo sviluppo di: i) un protocollo computazionale basato su metodi di campionamento avanzato delle configurazioni di proteine, per migliorare la predizione delle strutture di complessi formati tra proteine e molecole generiche; ii) un database di strutture di proteine di interesse farmacologico (circa 40) generate tramite l’algoritmo suddetto; iii) la realizzazione di un’applicazione web che implementi in maniera semplice e automatica il protocollo di cui al punto i). Il titolare dell’assegno si occuperà in particolare di sviluppare i punti i) e ii), mentre il punto iii) verrà affidato ad un secondo assegnista. È richiesta familiarità con le tecniche di docking molecolare, dinamica molecolare, analisi a clusters; scripting nei linguaggi bash, tcl, python; competenze informatiche sui database relazionali. |
| Descrizione sintetica in inglese | The goals of the research project are to develop: i) a computational protocol based on advanced methods to sample protein configurations, in order to improve the prediction of the structures of complexes formed between these proteins and generic molecules; ii) a database of protein structures of pharmacological interest (about 40) generated through the aforementioned algorithm; iii) the creation of a web application that implements the protocol referred to at point i) in a simple and automatic manner. The fellow will be responsible for points i) and ii), while point iii) will be entrusted to a second fellow. Familiarity is required with molecular docking, molecular dynamics, cluster analysis techniques; scripting in bash, tcl, python languages; knowledge of relational databases. |
| Data del bando | 29/06/2022 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università di Cagliari |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | https://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| vargiu@dsf.unica.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 19/07/2022 |
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| Come candidarsi | Other |