Descrizione del bando

Titolo del progetto di ricerca in italiano	Analisi bioinformatica di dati genomici e trascrittomici in malattie del neurosviluppo
Titolo del progetto di ricerca in inglese	Bioinformatic analysis of genomics and transcriptomics data in neurodevelopmental disorders
Campo principale della ricerca	Chemistry
Sottocampo della ricerca	Biochemistry
Settore Concorsuale	05 - Scienze biologiche
S.S.D	BIO/10 - BIOCHIMICA
Descrizione sintetica in italiano	I geni che contribuiscono alle malattie del neurosviluppo (NDDs) mostrano ruoli funzionali e pattern di espressione convergenti nel cervello. L’Assegnista utilizzerà analisi di rete in silico per scoprire nuovi geni di rischio. Genererà reti PPI di proteine coinvolte nelle NDDs a partire dai geni della Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) e DECIPHER e mapperà i geni con varianti emersi nell’ambito del progetto. Verranno generate reti PPI arricchite, segmentate in communities e analizzate da un punto di vista topologico. Inoltre, verrà eseguita un'analisi funzionale dei geni. Inoltre, all’Assegnista verrà chiesto di valutare l'uso di metodi di machine learning per prevedere i geni correlati al rischio di NDDs (dalle caratteristiche della posizione nelle reti, dalle metriche geniche e altri parametri). Inoltre, mediante analisi statistica, valuterà le prestazioni dei classificatori e delle reti neurali. Infine, dovrà condividere i risultati ottenuti.
Descrizione sintetica in inglese	Genes known to contribute to neurodevelopmental disorders (NDDs) show convergent functional roles and expression patterns in the brain. The research fellow will use in silico network analyses to uncover new risk genes. He/She will generate PPI networks of proteins involved in NDDs starting with genes in the Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) and DECIPHER and mapping variant-carrying genes from this study. More comprehensive PPI networks will be generated, clustered into communities, and analyzed from a topological viewpoint. Moreover, a functional analysis of genes will be performed. The research fellow will be asked to investigate the use of machine learning methods to predict disease risk genes from network topology features, gene-level constraint metrics, and other general features. Moreover, he/she will analyze the performance of the classifiers and the deep neural networks using (standard) statistical measures and share results.
Data del bando	01/08/2022
Numero di assegnazioni per anno	1
Paesi in cui può essere condotta la ricerca	Italy
Paesi di residenza dei candidati	EUROPE
Nazionalità dei candidati	EUROPE
Sito web del bando	https://www.uninsubria.it/opportunita/n-1-assegno-di-ricerca-dipartimentale-dal-titolo-analisi-bioinformatica-di-dati-genomici

 

Dettagli dell'assegno di ricerca

Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group)	Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc)
Importo annuale	20117.55
Valuta	Euro
Massima durata dell'assegno (mesi)	24
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione)	Possono partecipare alla selezione studiosi con un curriculum scientifico professionale idoneo allo svolgimento di attività di ricerca prevista dalla presente selezione in possesso di uno dei seguenti titoli di studio: - Laurea in Biologia o equipollente - Dottorato di Ricerca in Neurobiologia - analogo titolo accademico conseguito all’estero e riconosciuto equipollente
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione)	All those who have received a degree in Biology and who have an appropriate scientific-professional curriculum to carry out research activities established by this competition notice can participate in this public selection. PhD in Neurobiology or equivalent qualification earned abroad is required for admission according to this competition notice.
Processo di selezione in italiano (breve descrizione)	Valutazione comparativa dei curricula dei candidati che hanno presentato domanda sulla base di titoli e pubblicazioni.
Processo di selezione in inglese (breve descrizione)	The selection process is based on qualifications aiming at verifying the candidate's aptitude to fellowship research.

 

Finanziatore

Nome dell'Ente finanziatore	Università degli Studi dell'Insubria - Dipartimento di Scienza e Alta Tecnologia
Tipologia dell'Ente	Public research
Paese dell'Ente	Italy
Città	Como
Codice postale	22100
Indirizzo	Via Valleggio, 11
Sito web	https://www.uninsubria.it/ugov/organizationunit/7976

 

Contatto presso l'Ente

E-mail	segreteria.dipsat@uninsubria.it

 

EU Research Framework Programme

L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme?	No

 

Dettagli per la candidatura

Data di scadenza del bando	15/09/2022 - alle ore 00:00
Come candidarsi	https://pica.cineca.it/uninsubria/