Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Biodiversity genomics of Italian ants |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Biodiversity genomics of Italian ants |
| Campo principale della ricerca | Biological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Zoology |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Le attivita` del progetto possono essere cosi` sintetizzate: a) Isolamento del DNA da pool di individui su specie di formiche selezionate. Saranno provati diversi metodi di isolamento del DNA, per trovare le procedure piu` affidabili per l'estrazione di DNA genomico di alta qualita`. b) Analisi delle raw reads ottenute e data mining: I. trimming e pulizia dai contaminanti delle short reads, e messa a punto della pipeline bioinformatica per le successive analisi. II. analisi della diversita` genomica basata su k-mer, assegnazioni tassonomiche tramite DNA mark; III. caratterizzazione del mobiloma basata sulle short reads ed analisi comparativa genomica delle sue variazioni mobiloma; IV. assemblaggio dei contig per campione, ottenimento dell'intero genoma mitocondriale, dei geni ribosomiali e delle sequenze codificanti proteine (CDS), con ricerca degli ortologhi. c) analisi della diversita` genomica con analisi filogenomiche e di DNA barcoding esteso. |
| Descrizione sintetica in inglese | The project activities can be summarized as follows: a. DNA isolation from pool of individuals on selected ant species. Different DNA isolation methods will be tested to find the most reliable procedures for high quality genomic DNA extraction. b. Analysis of the raw reads obtained and data mining: I. Trimming and cleaning from contaminants of short reads, and fine-tuning of the bioinformatics pipeline for subsequent analyzes. II. Genomic diversity analysis based on k-mer, taxonomic assignments via DNA mark. III. Characterization of the mobilome based on short reads and genomic comparative analysis of its mobilome variations. IV. Assembly of contig per sample, to obtain the entire mitochondrial genome, ribosomal genes, and protein coding sequences (CDS), further performing search for orthologues. c. Analysis of genomic diversity with phylogenomic and extended DNA barcoding analyses. |
| Data del bando | 14/10/2022 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOLOGICHE, GEOLOGICHE E AMBIENTALI |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| bigea.nonstrutturati@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 16/11/2022 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |