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| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Un click per generare librerie di peptidi con centri catalitici tridimensionali |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | One click to grow libraries of helical peptides with 3D catalytic center |
| Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Con questo progetto, si vuole sviluppare una nova strategia basata sul legare frammenti peptidici in modio da forzarli ad assumere una conformazione elicoidale. Usando per la prima volta nella sintesi chimica dei peptidi la “a Schiff-base mediated ligation” vorremmo mostrare che una miscela di frammenti peptidici si possono combinatorialmente unire, e immediatamente utilizzare, in reazioni di affinità per vati target di interesse. Con questo approccio si possono generare centinaia di peptidi in una sola reazione. Successivamente i peptidi saranno selezionati per la loro affinità verso proteine target che saranno a loro volta immobilizzate in beads, e i migliori leganti saranno poi identificati attraverso la spettroscopia di massa. Questo approccio sarà rivolto all’incremento dello stato dell’arte dei peptidi come organo catalizzatori, mediante la costruzione di siti catalitici tridimensionali. |
| Descrizione sintetica in inglese | With this proposal, we want to develop a novel strategy leveraged on ligation of peptide fragments and constrains the peptide’s conformation into an α-helix. Using a Schiff-base mediated ligation we would show that a mixture of peptide fragments could be combinatorially ligated and used directly in affinity selection against a target of interest. By this approach we will generate hundred peptides in a one-pot ligation reaction and successively they will be selected by affinity against a target protein immobilized on beads, and the best binders will next identified by mass spectrometry. Moreover, with this approach we plan to improve the current state of the art of artificial peptide catalysts, by mimicking enzymes based on short helical structure able to encode a 3D catalytic center suitable for specific transformations in organocatalysts. So far, the main limitation of the research on peptide catalysis is the obstacle to pass from a 2D to a 3D catalytic center. |
| Data del bando | 07/11/2022 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | https://protocollo.unipd.it/albo/viewer |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli studi di Padova |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | https://www.unipd.it/ |
| scientifica.chimica@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 22/11/2022 - alle ore 00:00 |
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