Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi di dati di sequenziamento ottenuti da campioni positivi al SARS-CoV-2 |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Analysis of sequencing data from SARS-CoV-2 positive samples |
| Campo principale della ricerca | Medical sciences |
| Sottocampo della ricerca | Medicine |
| Settore Concorsuale | 06 - Scienze mediche |
| S.S.D | MED/07 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
| Descrizione sintetica in italiano | La persona candidata lavorerà al processamento dei dati di sequenziamento al fine di identificare varianti genomiche associate a fenotipi di malattia COVID-19 e, inclusi metadati clinici e indagini di laboratorio (suscettibilità, sintomatologia, livelli anticorpali, espansione dei linfociti B e T). Sarà valutata anche l’evoluzione del genoma virale in campioni longitudinali. L’assegnista sarà coinvolto nello sviluppo nell’ analisi dei dati NGS per l'assemblaggio di genomi virali e di rilevazione di polimorfismi, sia a livello di sequenza consenso che di varianti minoritarie presenti solo in una parte delle reads ottenute dal sequenziamento. Sono richieste competenze di programmazione (Python, R) e di utilizzo di sistemi cluster basati su interfaccia Linux da linea di comando |
| Descrizione sintetica in inglese | The candidate will perform data processing in order to identify genomic variants associated to COVID-19 phenotypes, including clinical metadata and laboratory analyses (susceptibility, symptoms, antibody levels, B and T cell expansion). Viral genome evolution will be assessed in longitudinal samples. The research fellow will be involved in the development of NGS data analysis pipelines for the assembly of viral genomes and for the detection of polymorphisms, both at the consensus level and also the minority variants that are present in only a fraction of the reads obtained through sequencing. The candidate needs to possess skills related to programming (Python, R) and to the use of computer clusters based on Linux command line interface. |
| Data del bando | 16/11/2022 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| E' richiesta mobilità internazionale? | no |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | https://www.medicinamolecolare.unipd.it/bando-di-selezione-il-conferimento-di-n-01-assegno-di-tipo-la-collaborazione-ad-attivit%C3%A0-di-ricer-22 |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
| Importo annuale | 19367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Altri costi in italiano | Costi previdenziali e assistenziali |
| Altri costi in inglese | Social security contributions |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Titoli e colloquio |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | Comparative assessment and interview |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Valutazione comparativa di titoli, curriculum scientifico, pubblicazioni scientifiche e colloquio |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Comparative assessment of qualifications, scientific curriculum, scientific publications and interview |
| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova - Dipartimento di Medicina Molecolare |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Academic |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Codice postale | 35121 |
| Indirizzo | Via A. Gabelli n. 63 |
| Sito web | https://www.medicinamolecolare.unipd.it/ |
| ricerca.dmm@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 01/12/2022 |
|---|---|
| Come candidarsi | Other |