Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di metodi computazionali per la genomica e l'epigenomica di terza generazione |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | University of Florence- Development of computational methods for third generation genomics and epigenomics- published on the |
Campo principale della ricerca | Engineering |
Sottocampo della ricerca | Biomedical engineering |
Settore Concorsuale | 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione |
S.S.D | ING-INF/06 - BIOINGEGNERIA ELETTRONICA E INFORMATICA |
Descrizione sintetica in italiano | Lo scopo del progetto sarà quello di valutare la capacità delle sequenze lunghe ottenute dal sequenziamento a nanopori ad alta copertura di studiare lo stato di metilazione dei genomi tumorali e di sviluppare nuovi metodi computazionali capaci di analizzare questa nuova generazione di dati epigenomici per l'individuazione di marcatori tumorali. A tal fine sarà condotto il sequenziamento dell'intero genoma, ad alta copertura, di campioni tumorali e dei rispettivi campioni di controllo usando la piattaforma Promethion 2 solo della Oxford Nanopore Technologies. Il vincitore dell'assegno di ricerca sarà coinvolto nell'analisi e nell'integrazione dei dati di metilazione con i dati di espressione genica ottenuti da sequenziamento Illumina. Inoltre contribuirà anche allo sviluppo di nuove pipeline computazionali per l'analisi dati epigenomici di terza generazione. |
Descrizione sintetica in inglese | The aim of the project will be to evaluate the ability of long sequences obtained from high-coverage nanopore sequencing to study the methylation status of tumor genomes and to develop new computational methods capable of analyzing this new generation of epigenomic data for the identification of tumor markers. To this end, genome-wide, high coverage sequencing of tumor samples and respective control samples will be conducted using the Oxford Nanopore Technologies Promethion 2 Solo platform. The research grant winner will be involved in the analysis and integration of the methylation data with the gene experiment data obtained from Illumina sequencing. It will also contribute to the development of new computational pipelines for third generation epigenomic data analysis. |
Data del bando | 16/11/2022 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://titulus.unifi.it/albo/viewer?view=files%2F004799258-UNFICLE-6eefaf7c-14ea-4f6c-a8ad-c3ea493cd6d5-000.pdf |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 29000 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Dottorato di ricerca in ambito scientifico affine all'oggetto del bando |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | PhD in a scientific field related to the object of the call |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | evaluation of titles and examination by means of an interview |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi Firenze |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Firenze |
Sito web | http://www.unifi.it |
amministrazione@dinfo.unifi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 05/12/2022 |
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Come candidarsi | Other |