Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Disegno computazionale di proteine per lo sviluppo di teranostici |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational protein design for theranostic development |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
Descrizione sintetica in italiano | Le attività si svolgeranno secondo un programma di ricerca finalizzato all’ingegnerizzazione di nuovi sistemi biologici con potenziale teranostico, quali Designer Receptor Exclusively Activated by Designer Drugs (DREADDs) per lo studio di specifiche vie di segnalazione biologica in vivo, e/o di anticorpi per modulare bersagli e processi molecolari di importanza biomedicale nel cancro e in malattie neurodegenerative. Il disegno di anticorpi in grado di legare una struttura proteica data sara’ una priorita’ della ricerca. Verranno utilizzate tecniche stato dell’arte in bioinformatica e machine learning per il disegno di proteine ed anticorpi, quali il pacchetto per il modeling molecolare Rosetta, ProteinMPNN, ProtGPT2, e saranno implementati software e procedure computazionali mediante l’utilizzo di tecniche all’avanguardia di deep-learning, quali modelli di linguaggio di proteine e reti neurali di grafi. |
Descrizione sintetica in inglese | The research is centered on engineering new biologics with theranostic potentials, such as Designer Receptor Exclusively Activated by Designer Drugs (DREADDs) to study specific biologic pathways in vivo and/or antibodies for modulating targets and processes of biomedical relevance in cancer and neurodegenerative disorders. The design of antibodies able to bind a given target protein structure will represent a priority of the research activity. In the developing of the project, there will be used state-of-art bioinformatics and machine learning techniques for protein and antibody design, such as the Rosetta molecular modeling suite, ProteinMPNN, ProtGPT2, as well as implementing customized pipelines through the usage of cutting-edge deep-learning frameworks, such as protein language models and graph neural networks. |
Data del bando | 07/12/2022 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://amministrazionetrasparente.sns.it/bando/disegno-computazionale-di-proteine-lo-sviluppo-di-teranostici-computational-protein-design-theranostic-development |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Importo annuale | 30000 |
Altri costi in italiano | L’importo lordo annuale dell’assegno, comprensivo di tutti gli oneri a carico dell’Amministrazione, è fissato in € 30.000,00= |
Altri costi in inglese | Annual gross remuneration, inclusive of all taxes: € 30.000,00 |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 24 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Possono presentare domanda per il conferimento dell’assegno gli studiosi in possesso del diploma di laurea in in discipline riconducibili ad una delle seguenti Aree CUN: scienze matematiche e informatiche; scienze fisiche; scienze chimiche; scienze biologiche; scienze farmacologiche; scienze mediche; ingegneria industriale e dell’informazione. Potranno partecipare altresì i candidati in possesso di un titolo di studio conseguito all’estero che sia riconosciuto equivalente al predetto titolo italiano. Per l’espletamento dell’attività è altresì richiesta la conoscenza della lingua inglese. |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The selection procedure is open to applicants who have completed a Master’s degree (in accordance with earlier Italian university regulations, or a second-cycle undergraduate degree as per the interdepartmental decree of 9 July, 2009) in disciplines related to the following scientific areas: Mathematics and Computer sciences; Physics; Chemistry; Biology; Pharmacological sciences; Medical sciences; Industrial and Information Engineering. Applicants who have completed the aforementioned degrees abroad may also apply, if that degree is recognized as equivalent to the corresponding Italian degree. Knowledge of English languages is also required to carry out the research activity. |
Nome dell'Ente finanziatore | Scuola Normale Superiore |
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Tipologia dell'Ente | Academic |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Pisa |
Codice postale | 56126 |
Indirizzo | Piazza dei Cavalieri n. 7 |
Sito web | http://www.sns.it |
job.opportunities@sns.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | HE |
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Data di scadenza del bando | 09/01/2023 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it/sns/ |